Protein–RNA interactions for Protein: Q78IS1

Tmed3, Transmembrane emp24 domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed3Q78IS1 Cdnf-201ENSMUST00000036350 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tmed3Q78IS1 Cramp1l-201ENSMUST00000073337 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tmed3Q78IS1 Gm36957-201ENSMUST00000192982 2824 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Tmed3Q78IS1 Pcdhga3-201ENSMUST00000073447 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tmed3Q78IS1 Apbb1-201ENSMUST00000081165 2530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tmed3Q78IS1 Zfyve1-203ENSMUST00000221919 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tmed3Q78IS1 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tmed3Q78IS1 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tmed3Q78IS1 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tmed3Q78IS1 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tmed3Q78IS1 Fads6-201ENSMUST00000056153 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tmed3Q78IS1 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tmed3Q78IS1 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tmed3Q78IS1 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tmed3Q78IS1 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tmed3Q78IS1 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tmed3Q78IS1 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tmed3Q78IS1 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tmed3Q78IS1 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tmed3Q78IS1 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Tmed3Q78IS1 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tmed3Q78IS1 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tmed3Q78IS1 Hs6st2-202ENSMUST00000114871 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tmed3Q78IS1 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tmed3Q78IS1 Rtn3-202ENSMUST00000065304 5030 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tmed3Q78IS1 Ambra1-203ENSMUST00000099712 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tmed3Q78IS1 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Tmed3Q78IS1 P2rx7-203ENSMUST00000100737 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tmed3Q78IS1 Nol4-204ENSMUST00000097651 4549 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tmed3Q78IS1 Aldh3a1-202ENSMUST00000108716 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tmed3Q78IS1 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tmed3Q78IS1 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tmed3Q78IS1 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tmed3Q78IS1 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tmed3Q78IS1 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tmed3Q78IS1 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tmed3Q78IS1 Pcdhgb7-201ENSMUST00000194928 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tmed3Q78IS1 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tmed3Q78IS1 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Tmed3Q78IS1 Rimbp2-204ENSMUST00000198941 6446 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tmed3Q78IS1 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tmed3Q78IS1 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tmed3Q78IS1 Cul9-204ENSMUST00000182485 7848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tmed3Q78IS1 Gm18983-201ENSMUST00000222884 2729 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Tmed3Q78IS1 Pcsk7-201ENSMUST00000039059 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tmed3Q78IS1 Adgre5-208ENSMUST00000166939 2980 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tmed3Q78IS1 Adgre5-201ENSMUST00000002964 2986 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tmed3Q78IS1 4933434E20Rik-206ENSMUST00000160640 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tmed3Q78IS1 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tmed3Q78IS1 Kcnj5-203ENSMUST00000216033 2440 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tmed3Q78IS1 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tmed3Q78IS1 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tmed3Q78IS1 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tmed3Q78IS1 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tmed3Q78IS1 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tmed3Q78IS1 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Tmed3Q78IS1 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Tmed3Q78IS1 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tmed3Q78IS1 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tmed3Q78IS1 Dcaf11-203ENSMUST00000117701 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tmed3Q78IS1 Cdh22-201ENSMUST00000065438 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tmed3Q78IS1 Anxa7-202ENSMUST00000100844 2904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tmed3Q78IS1 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tmed3Q78IS1 Tcf4-252ENSMUST00000202477 1873 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tmed3Q78IS1 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tmed3Q78IS1 AC124433.1-202ENSMUST00000224762 1535 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Tmed3Q78IS1 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tmed3Q78IS1 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tmed3Q78IS1 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tmed3Q78IS1 Ppp1r18-202ENSMUST00000122899 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tmed3Q78IS1 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tmed3Q78IS1 Tmx3-201ENSMUST00000025515 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tmed3Q78IS1 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tmed3Q78IS1 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tmed3Q78IS1 Fmo2-202ENSMUST00000111510 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tmed3Q78IS1 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tmed3Q78IS1 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tmed3Q78IS1 4930432E11Rik-202ENSMUST00000063585 10871 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Tmed3Q78IS1 Kif1a-210ENSMUST00000190723 6141 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tmed3Q78IS1 Bcl11a-201ENSMUST00000000881 3061 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tmed3Q78IS1 Prr12-201ENSMUST00000057293 7023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tmed3Q78IS1 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tmed3Q78IS1 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tmed3Q78IS1 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tmed3Q78IS1 Zfp593-201ENSMUST00000030644 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tmed3Q78IS1 Pafah2-201ENSMUST00000105869 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tmed3Q78IS1 Gm43860-201ENSMUST00000201742 2705 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Tmed3Q78IS1 Sec14l4-201ENSMUST00000019512 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tmed3Q78IS1 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tmed3Q78IS1 Ly75-202ENSMUST00000112533 6901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tmed3Q78IS1 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tmed3Q78IS1 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tmed3Q78IS1 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tmed3Q78IS1 Ece1-201ENSMUST00000102518 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tmed3Q78IS1 Rnf223-201ENSMUST00000209248 2908 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tmed3Q78IS1 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tmed3Q78IS1 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tmed3Q78IS1 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tmed3Q78IS1 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tmed3Q78IS1 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms