Protein–RNA interactions for Protein: Q715T0

Nme8, Thioredoxin domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nme8Q715T0 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Nme8Q715T0 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Nme8Q715T0 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nme8Q715T0 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Nme8Q715T0 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nme8Q715T0 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nme8Q715T0 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nme8Q715T0 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nme8Q715T0 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nme8Q715T0 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nme8Q715T0 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nme8Q715T0 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nme8Q715T0 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nme8Q715T0 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nme8Q715T0 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nme8Q715T0 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nme8Q715T0 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nme8Q715T0 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nme8Q715T0 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Nme8Q715T0 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nme8Q715T0 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nme8Q715T0 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nme8Q715T0 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nme8Q715T0 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nme8Q715T0 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nme8Q715T0 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nme8Q715T0 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nme8Q715T0 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nme8Q715T0 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nme8Q715T0 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nme8Q715T0 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nme8Q715T0 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nme8Q715T0 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nme8Q715T0 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Nme8Q715T0 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nme8Q715T0 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nme8Q715T0 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nme8Q715T0 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nme8Q715T0 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nme8Q715T0 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nme8Q715T0 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nme8Q715T0 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nme8Q715T0 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nme8Q715T0 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nme8Q715T0 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nme8Q715T0 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nme8Q715T0 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nme8Q715T0 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nme8Q715T0 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nme8Q715T0 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nme8Q715T0 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nme8Q715T0 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nme8Q715T0 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nme8Q715T0 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nme8Q715T0 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nme8Q715T0 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nme8Q715T0 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Nme8Q715T0 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nme8Q715T0 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nme8Q715T0 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Nme8Q715T0 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nme8Q715T0 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nme8Q715T0 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nme8Q715T0 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nme8Q715T0 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nme8Q715T0 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nme8Q715T0 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nme8Q715T0 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nme8Q715T0 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Nme8Q715T0 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nme8Q715T0 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nme8Q715T0 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nme8Q715T0 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nme8Q715T0 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nme8Q715T0 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nme8Q715T0 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nme8Q715T0 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nme8Q715T0 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nme8Q715T0 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nme8Q715T0 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nme8Q715T0 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nme8Q715T0 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Nme8Q715T0 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Nme8Q715T0 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Nme8Q715T0 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Nme8Q715T0 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nme8Q715T0 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Nme8Q715T0 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Nme8Q715T0 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Nme8Q715T0 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Nme8Q715T0 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Nme8Q715T0 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nme8Q715T0 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nme8Q715T0 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nme8Q715T0 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nme8Q715T0 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nme8Q715T0 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nme8Q715T0 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nme8Q715T0 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nme8Q715T0 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.9 ms