Protein–RNA interactions for Protein: Q6XAS4

Ssxb3, SSXB3 protein, mousemouse

Predictions only

Length 170 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssxb3Q6XAS4 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ssxb3Q6XAS4 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ssxb3Q6XAS4 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ssxb3Q6XAS4 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ssxb3Q6XAS4 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ssxb3Q6XAS4 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ssxb3Q6XAS4 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ssxb3Q6XAS4 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ssxb3Q6XAS4 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ssxb3Q6XAS4 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ssxb3Q6XAS4 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ssxb3Q6XAS4 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ssxb3Q6XAS4 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ssxb3Q6XAS4 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ssxb3Q6XAS4 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ssxb3Q6XAS4 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ssxb3Q6XAS4 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ssxb3Q6XAS4 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ssxb3Q6XAS4 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ssxb3Q6XAS4 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ssxb3Q6XAS4 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ssxb3Q6XAS4 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ssxb3Q6XAS4 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ssxb3Q6XAS4 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ssxb3Q6XAS4 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ssxb3Q6XAS4 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ssxb3Q6XAS4 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ssxb3Q6XAS4 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ssxb3Q6XAS4 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ssxb3Q6XAS4 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ssxb3Q6XAS4 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ssxb3Q6XAS4 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ssxb3Q6XAS4 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ssxb3Q6XAS4 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ssxb3Q6XAS4 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ssxb3Q6XAS4 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ssxb3Q6XAS4 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ssxb3Q6XAS4 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ssxb3Q6XAS4 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ssxb3Q6XAS4 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ssxb3Q6XAS4 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ssxb3Q6XAS4 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Ssxb3Q6XAS4 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ssxb3Q6XAS4 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Ssxb3Q6XAS4 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ssxb3Q6XAS4 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ssxb3Q6XAS4 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ssxb3Q6XAS4 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ssxb3Q6XAS4 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ssxb3Q6XAS4 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ssxb3Q6XAS4 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ssxb3Q6XAS4 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ssxb3Q6XAS4 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ssxb3Q6XAS4 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ssxb3Q6XAS4 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ssxb3Q6XAS4 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ssxb3Q6XAS4 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ssxb3Q6XAS4 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ssxb3Q6XAS4 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ssxb3Q6XAS4 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ssxb3Q6XAS4 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ssxb3Q6XAS4 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ssxb3Q6XAS4 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ssxb3Q6XAS4 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ssxb3Q6XAS4 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ssxb3Q6XAS4 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ssxb3Q6XAS4 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ssxb3Q6XAS4 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ssxb3Q6XAS4 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ssxb3Q6XAS4 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ssxb3Q6XAS4 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ssxb3Q6XAS4 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ssxb3Q6XAS4 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ssxb3Q6XAS4 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Ssxb3Q6XAS4 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ssxb3Q6XAS4 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Ssxb3Q6XAS4 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ssxb3Q6XAS4 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Ssxb3Q6XAS4 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ssxb3Q6XAS4 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ssxb3Q6XAS4 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ssxb3Q6XAS4 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ssxb3Q6XAS4 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ssxb3Q6XAS4 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ssxb3Q6XAS4 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ssxb3Q6XAS4 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ssxb3Q6XAS4 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Ssxb3Q6XAS4 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ssxb3Q6XAS4 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ssxb3Q6XAS4 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ssxb3Q6XAS4 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ssxb3Q6XAS4 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ssxb3Q6XAS4 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ssxb3Q6XAS4 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ssxb3Q6XAS4 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ssxb3Q6XAS4 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ssxb3Q6XAS4 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ssxb3Q6XAS4 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ssxb3Q6XAS4 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ssxb3Q6XAS4 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
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