Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDK0

Zbtb39, Zinc finger and BTB domain-containing 39, mousemouse

Predictions only

Length 712 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbtb39Q6PDK0 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Zbtb39Q6PDK0 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Zbtb39Q6PDK0 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Zbtb39Q6PDK0 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Zbtb39Q6PDK0 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Zbtb39Q6PDK0 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Zbtb39Q6PDK0 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Zbtb39Q6PDK0 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Zbtb39Q6PDK0 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Zbtb39Q6PDK0 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Zbtb39Q6PDK0 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Zbtb39Q6PDK0 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Zbtb39Q6PDK0 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Zbtb39Q6PDK0 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Zbtb39Q6PDK0 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Zbtb39Q6PDK0 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Zbtb39Q6PDK0 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Zbtb39Q6PDK0 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Zbtb39Q6PDK0 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Zbtb39Q6PDK0 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Zbtb39Q6PDK0 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Zbtb39Q6PDK0 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Zbtb39Q6PDK0 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Zbtb39Q6PDK0 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Zbtb39Q6PDK0 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Zbtb39Q6PDK0 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Zbtb39Q6PDK0 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Zbtb39Q6PDK0 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Zbtb39Q6PDK0 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Zbtb39Q6PDK0 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Zbtb39Q6PDK0 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Zbtb39Q6PDK0 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Zbtb39Q6PDK0 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Zbtb39Q6PDK0 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Zbtb39Q6PDK0 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Zbtb39Q6PDK0 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Zbtb39Q6PDK0 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Zbtb39Q6PDK0 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Zbtb39Q6PDK0 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Zbtb39Q6PDK0 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Zbtb39Q6PDK0 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Zbtb39Q6PDK0 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Zbtb39Q6PDK0 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Zbtb39Q6PDK0 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Zbtb39Q6PDK0 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Zbtb39Q6PDK0 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Zbtb39Q6PDK0 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Zbtb39Q6PDK0 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Zbtb39Q6PDK0 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Zbtb39Q6PDK0 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Zbtb39Q6PDK0 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Zbtb39Q6PDK0 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Zbtb39Q6PDK0 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Zbtb39Q6PDK0 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Zbtb39Q6PDK0 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Zbtb39Q6PDK0 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Zbtb39Q6PDK0 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Zbtb39Q6PDK0 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Zbtb39Q6PDK0 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Zbtb39Q6PDK0 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Zbtb39Q6PDK0 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Zbtb39Q6PDK0 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Zbtb39Q6PDK0 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Zbtb39Q6PDK0 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Zbtb39Q6PDK0 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Zbtb39Q6PDK0 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Zbtb39Q6PDK0 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Zbtb39Q6PDK0 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Zbtb39Q6PDK0 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Zbtb39Q6PDK0 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Zbtb39Q6PDK0 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Zbtb39Q6PDK0 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Zbtb39Q6PDK0 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Zbtb39Q6PDK0 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Zbtb39Q6PDK0 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Zbtb39Q6PDK0 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Zbtb39Q6PDK0 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Zbtb39Q6PDK0 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Zbtb39Q6PDK0 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Zbtb39Q6PDK0 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Zbtb39Q6PDK0 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Zbtb39Q6PDK0 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Zbtb39Q6PDK0 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Zbtb39Q6PDK0 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Zbtb39Q6PDK0 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Zbtb39Q6PDK0 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Zbtb39Q6PDK0 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Zbtb39Q6PDK0 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Zbtb39Q6PDK0 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Zbtb39Q6PDK0 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Zbtb39Q6PDK0 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Zbtb39Q6PDK0 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Zbtb39Q6PDK0 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Zbtb39Q6PDK0 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Zbtb39Q6PDK0 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Zbtb39Q6PDK0 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Zbtb39Q6PDK0 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Zbtb39Q6PDK0 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Zbtb39Q6PDK0 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Zbtb39Q6PDK0 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.3 ms