Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDG5

Smarcc2, SWI/SNF complex subunit SMARCC2, mousemouse

Predictions only

Length 1,213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarcc2Q6PDG5 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Smarcc2Q6PDG5 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Smarcc2Q6PDG5 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Smarcc2Q6PDG5 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Smarcc2Q6PDG5 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Smarcc2Q6PDG5 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Smarcc2Q6PDG5 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Smarcc2Q6PDG5 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Smarcc2Q6PDG5 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Smarcc2Q6PDG5 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Smarcc2Q6PDG5 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Smarcc2Q6PDG5 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Smarcc2Q6PDG5 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Smarcc2Q6PDG5 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Smarcc2Q6PDG5 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Smarcc2Q6PDG5 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Smarcc2Q6PDG5 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Smarcc2Q6PDG5 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Smarcc2Q6PDG5 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smarcc2Q6PDG5 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smarcc2Q6PDG5 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smarcc2Q6PDG5 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smarcc2Q6PDG5 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smarcc2Q6PDG5 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smarcc2Q6PDG5 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smarcc2Q6PDG5 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smarcc2Q6PDG5 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smarcc2Q6PDG5 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smarcc2Q6PDG5 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smarcc2Q6PDG5 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Smarcc2Q6PDG5 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smarcc2Q6PDG5 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smarcc2Q6PDG5 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smarcc2Q6PDG5 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smarcc2Q6PDG5 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smarcc2Q6PDG5 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smarcc2Q6PDG5 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smarcc2Q6PDG5 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smarcc2Q6PDG5 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smarcc2Q6PDG5 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smarcc2Q6PDG5 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smarcc2Q6PDG5 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smarcc2Q6PDG5 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smarcc2Q6PDG5 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smarcc2Q6PDG5 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smarcc2Q6PDG5 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Smarcc2Q6PDG5 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smarcc2Q6PDG5 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smarcc2Q6PDG5 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smarcc2Q6PDG5 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Smarcc2Q6PDG5 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smarcc2Q6PDG5 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smarcc2Q6PDG5 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smarcc2Q6PDG5 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smarcc2Q6PDG5 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smarcc2Q6PDG5 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smarcc2Q6PDG5 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Smarcc2Q6PDG5 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smarcc2Q6PDG5 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smarcc2Q6PDG5 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smarcc2Q6PDG5 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smarcc2Q6PDG5 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smarcc2Q6PDG5 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smarcc2Q6PDG5 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smarcc2Q6PDG5 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smarcc2Q6PDG5 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smarcc2Q6PDG5 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smarcc2Q6PDG5 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smarcc2Q6PDG5 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smarcc2Q6PDG5 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smarcc2Q6PDG5 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smarcc2Q6PDG5 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smarcc2Q6PDG5 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smarcc2Q6PDG5 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smarcc2Q6PDG5 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smarcc2Q6PDG5 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smarcc2Q6PDG5 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smarcc2Q6PDG5 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smarcc2Q6PDG5 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smarcc2Q6PDG5 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smarcc2Q6PDG5 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smarcc2Q6PDG5 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smarcc2Q6PDG5 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smarcc2Q6PDG5 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smarcc2Q6PDG5 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smarcc2Q6PDG5 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smarcc2Q6PDG5 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smarcc2Q6PDG5 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smarcc2Q6PDG5 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smarcc2Q6PDG5 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smarcc2Q6PDG5 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smarcc2Q6PDG5 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smarcc2Q6PDG5 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smarcc2Q6PDG5 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smarcc2Q6PDG5 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smarcc2Q6PDG5 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smarcc2Q6PDG5 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smarcc2Q6PDG5 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smarcc2Q6PDG5 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Smarcc2Q6PDG5 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms