Protein–RNA interactions for Protein: Q6PD31

Trak1, Trafficking kinesin-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 939 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trak1Q6PD31 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Trak1Q6PD31 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Trak1Q6PD31 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Trak1Q6PD31 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Trak1Q6PD31 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Trak1Q6PD31 Gm37008-201ENSMUST00000195712 319 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Trak1Q6PD31 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Trak1Q6PD31 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Trak1Q6PD31 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Trak1Q6PD31 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Trak1Q6PD31 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Trak1Q6PD31 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Trak1Q6PD31 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Trak1Q6PD31 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Trak1Q6PD31 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Trak1Q6PD31 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Trak1Q6PD31 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Trak1Q6PD31 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Trak1Q6PD31 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Trak1Q6PD31 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Trak1Q6PD31 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Trak1Q6PD31 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Trak1Q6PD31 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Trak1Q6PD31 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Trak1Q6PD31 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Trak1Q6PD31 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Trak1Q6PD31 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Trak1Q6PD31 1600014C10Rik-203ENSMUST00000177983 403 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Trak1Q6PD31 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Trak1Q6PD31 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Trak1Q6PD31 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Trak1Q6PD31 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Trak1Q6PD31 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Trak1Q6PD31 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Trak1Q6PD31 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Trak1Q6PD31 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Trak1Q6PD31 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Trak1Q6PD31 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Trak1Q6PD31 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Trak1Q6PD31 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Trak1Q6PD31 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Trak1Q6PD31 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Trak1Q6PD31 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Trak1Q6PD31 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Trak1Q6PD31 Gm25261-201ENSMUST00000157416 134 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Trak1Q6PD31 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Trak1Q6PD31 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Trak1Q6PD31 Mir8109-201ENSMUST00000184375 117 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Trak1Q6PD31 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Trak1Q6PD31 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Trak1Q6PD31 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Trak1Q6PD31 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Trak1Q6PD31 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Trak1Q6PD31 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Trak1Q6PD31 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Trak1Q6PD31 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Trak1Q6PD31 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Trak1Q6PD31 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Trak1Q6PD31 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Trak1Q6PD31 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Trak1Q6PD31 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Trak1Q6PD31 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Trak1Q6PD31 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Trak1Q6PD31 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Trak1Q6PD31 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Trak1Q6PD31 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Trak1Q6PD31 Ablim2-203ENSMUST00000114203 1333 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Trak1Q6PD31 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Trak1Q6PD31 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Trak1Q6PD31 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Trak1Q6PD31 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Trak1Q6PD31 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Trak1Q6PD31 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Trak1Q6PD31 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Trak1Q6PD31 Gas5-210ENSMUST00000159706 557 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Trak1Q6PD31 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Trak1Q6PD31 Gm43118-201ENSMUST00000199149 775 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Trak1Q6PD31 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Trak1Q6PD31 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Trak1Q6PD31 AC133598.1-201ENSMUST00000224327 660 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Trak1Q6PD31 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Trak1Q6PD31 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Trak1Q6PD31 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Trak1Q6PD31 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Trak1Q6PD31 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Trak1Q6PD31 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Trak1Q6PD31 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Trak1Q6PD31 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Trak1Q6PD31 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Trak1Q6PD31 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Trak1Q6PD31 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Trak1Q6PD31 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Trak1Q6PD31 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Trak1Q6PD31 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Trak1Q6PD31 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Trak1Q6PD31 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Trak1Q6PD31 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Trak1Q6PD31 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Trak1Q6PD31 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Trak1Q6PD31 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.7 ms