Protein–RNA interactions for Protein: Q6P8K3

BC061212, Predicted gene 7978, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC061212Q6P8K3 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
BC061212Q6P8K3 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
BC061212Q6P8K3 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
BC061212Q6P8K3 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
BC061212Q6P8K3 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
BC061212Q6P8K3 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
BC061212Q6P8K3 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
BC061212Q6P8K3 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
BC061212Q6P8K3 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
BC061212Q6P8K3 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
BC061212Q6P8K3 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
BC061212Q6P8K3 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
BC061212Q6P8K3 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
BC061212Q6P8K3 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
BC061212Q6P8K3 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
BC061212Q6P8K3 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
BC061212Q6P8K3 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
BC061212Q6P8K3 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
BC061212Q6P8K3 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
BC061212Q6P8K3 Myo10-201ENSMUST00000022882 5880 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
BC061212Q6P8K3 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
BC061212Q6P8K3 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
BC061212Q6P8K3 Itga2b-201ENSMUST00000103086 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
BC061212Q6P8K3 Brwd1-202ENSMUST00000099502 8547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
BC061212Q6P8K3 Pex5-205ENSMUST00000112532 3148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
BC061212Q6P8K3 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
BC061212Q6P8K3 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
BC061212Q6P8K3 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
BC061212Q6P8K3 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC12.36□□□□□ -0.43
BC061212Q6P8K3 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
BC061212Q6P8K3 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
BC061212Q6P8K3 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
BC061212Q6P8K3 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
BC061212Q6P8K3 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
BC061212Q6P8K3 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
BC061212Q6P8K3 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
BC061212Q6P8K3 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
BC061212Q6P8K3 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
BC061212Q6P8K3 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
BC061212Q6P8K3 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
BC061212Q6P8K3 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
BC061212Q6P8K3 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
BC061212Q6P8K3 AC124742.1-201ENSMUST00000219909 547 ntTSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
BC061212Q6P8K3 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
BC061212Q6P8K3 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
BC061212Q6P8K3 Gabpb1-204ENSMUST00000103227 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
BC061212Q6P8K3 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
BC061212Q6P8K3 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
BC061212Q6P8K3 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
BC061212Q6P8K3 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
BC061212Q6P8K3 Ibsp-201ENSMUST00000031246 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
BC061212Q6P8K3 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
BC061212Q6P8K3 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
BC061212Q6P8K3 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
BC061212Q6P8K3 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
BC061212Q6P8K3 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
BC061212Q6P8K3 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
BC061212Q6P8K3 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
BC061212Q6P8K3 AI464131-201ENSMUST00000054920 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
BC061212Q6P8K3 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
BC061212Q6P8K3 Ppfia4-205ENSMUST00000189361 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
BC061212Q6P8K3 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
BC061212Q6P8K3 Smpd3-201ENSMUST00000067512 5148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
BC061212Q6P8K3 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
BC061212Q6P8K3 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
BC061212Q6P8K3 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
BC061212Q6P8K3 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
BC061212Q6P8K3 Kcnt1-201ENSMUST00000037580 5881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
BC061212Q6P8K3 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
BC061212Q6P8K3 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
BC061212Q6P8K3 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
BC061212Q6P8K3 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
BC061212Q6P8K3 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
BC061212Q6P8K3 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
BC061212Q6P8K3 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
BC061212Q6P8K3 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
BC061212Q6P8K3 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
BC061212Q6P8K3 Gm43084-201ENSMUST00000200696 947 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
BC061212Q6P8K3 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
BC061212Q6P8K3 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
BC061212Q6P8K3 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
BC061212Q6P8K3 Slc35e2-202ENSMUST00000105608 6291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
BC061212Q6P8K3 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
BC061212Q6P8K3 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
BC061212Q6P8K3 Brd3-202ENSMUST00000077737 5272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
BC061212Q6P8K3 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
BC061212Q6P8K3 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
BC061212Q6P8K3 Myo6-204ENSMUST00000113268 7927 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
BC061212Q6P8K3 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
BC061212Q6P8K3 Rab11fip3-203ENSMUST00000122103 5015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
BC061212Q6P8K3 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
BC061212Q6P8K3 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
BC061212Q6P8K3 Gprasp1-201ENSMUST00000113144 5843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
BC061212Q6P8K3 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
BC061212Q6P8K3 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
BC061212Q6P8K3 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
BC061212Q6P8K3 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
BC061212Q6P8K3 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
BC061212Q6P8K3 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
BC061212Q6P8K3 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.5 ms