Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFX4

Krt39, Keratin, type I cytoskeletal 39, mousemouse

Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt39Q6IFX4 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Krt39Q6IFX4 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Krt39Q6IFX4 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Krt39Q6IFX4 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Krt39Q6IFX4 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Krt39Q6IFX4 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Krt39Q6IFX4 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Krt39Q6IFX4 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Krt39Q6IFX4 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Krt39Q6IFX4 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Krt39Q6IFX4 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Krt39Q6IFX4 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Krt39Q6IFX4 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Krt39Q6IFX4 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Krt39Q6IFX4 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Krt39Q6IFX4 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Krt39Q6IFX4 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Krt39Q6IFX4 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Krt39Q6IFX4 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Krt39Q6IFX4 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Krt39Q6IFX4 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Krt39Q6IFX4 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Krt39Q6IFX4 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Krt39Q6IFX4 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Krt39Q6IFX4 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Krt39Q6IFX4 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Krt39Q6IFX4 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Krt39Q6IFX4 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Krt39Q6IFX4 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Krt39Q6IFX4 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Krt39Q6IFX4 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Krt39Q6IFX4 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Krt39Q6IFX4 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Krt39Q6IFX4 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Krt39Q6IFX4 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Krt39Q6IFX4 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Krt39Q6IFX4 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Krt39Q6IFX4 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Krt39Q6IFX4 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Krt39Q6IFX4 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Krt39Q6IFX4 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Krt39Q6IFX4 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Krt39Q6IFX4 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Krt39Q6IFX4 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Krt39Q6IFX4 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Krt39Q6IFX4 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Krt39Q6IFX4 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Krt39Q6IFX4 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Krt39Q6IFX4 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Krt39Q6IFX4 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Krt39Q6IFX4 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Krt39Q6IFX4 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Krt39Q6IFX4 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Krt39Q6IFX4 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Krt39Q6IFX4 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Krt39Q6IFX4 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Krt39Q6IFX4 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Krt39Q6IFX4 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Krt39Q6IFX4 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Krt39Q6IFX4 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Krt39Q6IFX4 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Krt39Q6IFX4 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Krt39Q6IFX4 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Krt39Q6IFX4 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
Krt39Q6IFX4 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Krt39Q6IFX4 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Krt39Q6IFX4 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
Krt39Q6IFX4 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Krt39Q6IFX4 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Krt39Q6IFX4 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Krt39Q6IFX4 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Krt39Q6IFX4 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Krt39Q6IFX4 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Krt39Q6IFX4 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Krt39Q6IFX4 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Krt39Q6IFX4 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Krt39Q6IFX4 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Krt39Q6IFX4 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Krt39Q6IFX4 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Krt39Q6IFX4 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Krt39Q6IFX4 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Krt39Q6IFX4 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Krt39Q6IFX4 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Krt39Q6IFX4 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Krt39Q6IFX4 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Krt39Q6IFX4 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Krt39Q6IFX4 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Krt39Q6IFX4 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Krt39Q6IFX4 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Krt39Q6IFX4 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Krt39Q6IFX4 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Krt39Q6IFX4 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Krt39Q6IFX4 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Krt39Q6IFX4 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Krt39Q6IFX4 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Krt39Q6IFX4 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Krt39Q6IFX4 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Krt39Q6IFX4 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Krt39Q6IFX4 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Krt39Q6IFX4 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.8 ms