Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZK6

Jmjd1c, Probable JmjC domain-containing histone demethylation protein 2C, mousemouse

Predictions only

Length 2,350 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Jmjd1cQ69ZK6 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Jmjd1cQ69ZK6 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Jmjd1cQ69ZK6 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Jmjd1cQ69ZK6 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Jmjd1cQ69ZK6 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Jmjd1cQ69ZK6 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Jmjd1cQ69ZK6 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Jmjd1cQ69ZK6 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Jmjd1cQ69ZK6 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Jmjd1cQ69ZK6 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Jmjd1cQ69ZK6 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Jmjd1cQ69ZK6 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Jmjd1cQ69ZK6 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Jmjd1cQ69ZK6 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Jmjd1cQ69ZK6 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Jmjd1cQ69ZK6 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Jmjd1cQ69ZK6 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Jmjd1cQ69ZK6 Pagr1b-201ENSMUST00000172958 693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Jmjd1cQ69ZK6 Rn7s6-201ENSMUST00000175005 291 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Jmjd1cQ69ZK6 Qdpr-209ENSMUST00000198258 1172 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Jmjd1cQ69ZK6 AC127270.1-201ENSMUST00000221441 491 ntTSL 3 BASIC12.5□□□□□ -0.41
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Jmjd1cQ69ZK6 Cmtm2a-201ENSMUST00000034344 1081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Jmjd1cQ69ZK6 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Jmjd1cQ69ZK6 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
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Jmjd1cQ69ZK6 Zp3-201ENSMUST00000005073 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Jmjd1cQ69ZK6 Cd300lf-202ENSMUST00000106561 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
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Jmjd1cQ69ZK6 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Jmjd1cQ69ZK6 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
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Jmjd1cQ69ZK6 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
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Jmjd1cQ69ZK6 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
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Jmjd1cQ69ZK6 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Jmjd1cQ69ZK6 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
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Jmjd1cQ69ZK6 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Jmjd1cQ69ZK6 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Jmjd1cQ69ZK6 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
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Jmjd1cQ69ZK6 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Jmjd1cQ69ZK6 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Jmjd1cQ69ZK6 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Jmjd1cQ69ZK6 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Jmjd1cQ69ZK6 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Jmjd1cQ69ZK6 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Jmjd1cQ69ZK6 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Jmjd1cQ69ZK6 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Jmjd1cQ69ZK6 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Jmjd1cQ69ZK6 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Jmjd1cQ69ZK6 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Jmjd1cQ69ZK6 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Jmjd1cQ69ZK6 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Jmjd1cQ69ZK6 Gltp-202ENSMUST00000112212 799 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Jmjd1cQ69ZK6 Gm19459-201ENSMUST00000176240 835 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Jmjd1cQ69ZK6 Phgdh-ps1-201ENSMUST00000207540 754 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.2 ms