Protein–RNA interactions for Protein: Q64487

Ptprd, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, mousemouse

Predictions only

Length 1,912 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprdQ64487 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PtprdQ64487 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PtprdQ64487 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PtprdQ64487 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PtprdQ64487 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PtprdQ64487 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PtprdQ64487 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
PtprdQ64487 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
PtprdQ64487 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
PtprdQ64487 Gm16124-201ENSMUST00000146938 516 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
PtprdQ64487 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
PtprdQ64487 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PtprdQ64487 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PtprdQ64487 1700045I11Rik-201ENSMUST00000194752 493 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
PtprdQ64487 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PtprdQ64487 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
PtprdQ64487 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
PtprdQ64487 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
PtprdQ64487 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
PtprdQ64487 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
PtprdQ64487 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
PtprdQ64487 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
PtprdQ64487 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
PtprdQ64487 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
PtprdQ64487 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PtprdQ64487 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PtprdQ64487 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PtprdQ64487 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PtprdQ64487 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PtprdQ64487 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PtprdQ64487 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PtprdQ64487 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PtprdQ64487 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PtprdQ64487 Erich1-201ENSMUST00000110813 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PtprdQ64487 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PtprdQ64487 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PtprdQ64487 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PtprdQ64487 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PtprdQ64487 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PtprdQ64487 Gm2164-201ENSMUST00000184062 424 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PtprdQ64487 Gm37259-201ENSMUST00000193903 849 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
PtprdQ64487 Gm39318-201ENSMUST00000214606 1118 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PtprdQ64487 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PtprdQ64487 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
PtprdQ64487 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PtprdQ64487 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PtprdQ64487 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PtprdQ64487 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
PtprdQ64487 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PtprdQ64487 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PtprdQ64487 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PtprdQ64487 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PtprdQ64487 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PtprdQ64487 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PtprdQ64487 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
PtprdQ64487 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PtprdQ64487 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PtprdQ64487 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PtprdQ64487 Gm27516-201ENSMUST00000184237 98 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
PtprdQ64487 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
PtprdQ64487 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PtprdQ64487 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PtprdQ64487 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PtprdQ64487 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PtprdQ64487 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PtprdQ64487 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PtprdQ64487 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PtprdQ64487 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PtprdQ64487 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PtprdQ64487 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PtprdQ64487 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PtprdQ64487 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PtprdQ64487 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PtprdQ64487 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PtprdQ64487 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PtprdQ64487 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PtprdQ64487 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PtprdQ64487 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PtprdQ64487 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PtprdQ64487 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PtprdQ64487 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PtprdQ64487 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PtprdQ64487 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PtprdQ64487 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PtprdQ64487 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PtprdQ64487 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PtprdQ64487 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PtprdQ64487 1600014C10Rik-203ENSMUST00000177983 403 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PtprdQ64487 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PtprdQ64487 Gm37933-201ENSMUST00000193964 981 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PtprdQ64487 Gm38341-201ENSMUST00000195357 515 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
PtprdQ64487 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
PtprdQ64487 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PtprdQ64487 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PtprdQ64487 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PtprdQ64487 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PtprdQ64487 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PtprdQ64487 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PtprdQ64487 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PtprdQ64487 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.2 ms