Protein–RNA interactions for Protein: Q640N1

Aebp1, Adipocyte enhancer-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,128 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aebp1Q640N1 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Aebp1Q640N1 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Aebp1Q640N1 Gm11210-201ENSMUST00000150203 422 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Aebp1Q640N1 Cryge-202ENSMUST00000161960 690 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Aebp1Q640N1 C030017D09Rik-201ENSMUST00000163690 923 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Aebp1Q640N1 Anapc16-205ENSMUST00000182912 566 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Aebp1Q640N1 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Aebp1Q640N1 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Aebp1Q640N1 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Aebp1Q640N1 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Aebp1Q640N1 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Aebp1Q640N1 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Aebp1Q640N1 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Aebp1Q640N1 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Aebp1Q640N1 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Aebp1Q640N1 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Aebp1Q640N1 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Aebp1Q640N1 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Aebp1Q640N1 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Aebp1Q640N1 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Aebp1Q640N1 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Aebp1Q640N1 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Aebp1Q640N1 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Aebp1Q640N1 Eif3i-201ENSMUST00000102593 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Aebp1Q640N1 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Aebp1Q640N1 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Aebp1Q640N1 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Aebp1Q640N1 Lage3-201ENSMUST00000015433 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Aebp1Q640N1 Gm25668-201ENSMUST00000157700 129 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Aebp1Q640N1 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Aebp1Q640N1 Tm2d2-202ENSMUST00000210536 727 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Aebp1Q640N1 Ldha-213ENSMUST00000210631 685 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Aebp1Q640N1 Lrrc52-201ENSMUST00000036643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Aebp1Q640N1 Gm3402-201ENSMUST00000036715 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Aebp1Q640N1 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Aebp1Q640N1 Acyp1-202ENSMUST00000065913 448 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Aebp1Q640N1 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Aebp1Q640N1 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Aebp1Q640N1 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Aebp1Q640N1 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Aebp1Q640N1 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Aebp1Q640N1 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Aebp1Q640N1 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Aebp1Q640N1 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Aebp1Q640N1 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Aebp1Q640N1 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Aebp1Q640N1 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Aebp1Q640N1 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Aebp1Q640N1 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Aebp1Q640N1 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Aebp1Q640N1 1700088E04Rik-212ENSMUST00000190959 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Aebp1Q640N1 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Aebp1Q640N1 Gm12216-202ENSMUST00000120776 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Aebp1Q640N1 Pdlim2-205ENSMUST00000129174 729 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Aebp1Q640N1 Aamdc-210ENSMUST00000146605 642 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Aebp1Q640N1 Gm37312-201ENSMUST00000195753 685 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Aebp1Q640N1 CT573034.1-201ENSMUST00000222983 313 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Aebp1Q640N1 Zdhhc12-201ENSMUST00000081838 1187 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Aebp1Q640N1 Gm11559-201ENSMUST00000092694 1096 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Aebp1Q640N1 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Aebp1Q640N1 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Aebp1Q640N1 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Aebp1Q640N1 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Aebp1Q640N1 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Aebp1Q640N1 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Aebp1Q640N1 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Aebp1Q640N1 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Aebp1Q640N1 Gm44579-201ENSMUST00000142443 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Aebp1Q640N1 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Aebp1Q640N1 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Aebp1Q640N1 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Aebp1Q640N1 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Aebp1Q640N1 Etfrf1-207ENSMUST00000111726 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Aebp1Q640N1 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Aebp1Q640N1 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Aebp1Q640N1 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Aebp1Q640N1 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Aebp1Q640N1 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Aebp1Q640N1 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Aebp1Q640N1 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Aebp1Q640N1 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Aebp1Q640N1 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Aebp1Q640N1 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Aebp1Q640N1 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Aebp1Q640N1 Nsg2-203ENSMUST00000109409 641 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Aebp1Q640N1 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Aebp1Q640N1 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Aebp1Q640N1 Gm14019-201ENSMUST00000131514 403 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Aebp1Q640N1 Gm14230-202ENSMUST00000137463 874 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Aebp1Q640N1 Med9os-203ENSMUST00000146334 527 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Aebp1Q640N1 Gm8738-201ENSMUST00000172606 329 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Aebp1Q640N1 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Aebp1Q640N1 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Aebp1Q640N1 Coq7-202ENSMUST00000098090 1215 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Aebp1Q640N1 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Aebp1Q640N1 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Aebp1Q640N1 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Aebp1Q640N1 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Aebp1Q640N1 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC20.45■□□□□ 0.87
Aebp1Q640N1 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms