Protein–RNA interactions for Protein: Q62280

Ss18, Protein SSXT, mousemouse

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Length 418 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ss18Q62280 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ss18Q62280 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ss18Q62280 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Ss18Q62280 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Ss18Q62280 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ss18Q62280 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ss18Q62280 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Ss18Q62280 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ss18Q62280 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ss18Q62280 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ss18Q62280 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ss18Q62280 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ss18Q62280 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ss18Q62280 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ss18Q62280 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ss18Q62280 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ss18Q62280 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ss18Q62280 Lmbr1-202ENSMUST00000179191 4836 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ss18Q62280 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ss18Q62280 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ss18Q62280 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ss18Q62280 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ss18Q62280 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ss18Q62280 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ss18Q62280 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ss18Q62280 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ss18Q62280 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ss18Q62280 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ss18Q62280 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ss18Q62280 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC10.05□□□□□ -0.8
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Ss18Q62280 Insrr-201ENSMUST00000029711 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ss18Q62280 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ss18Q62280 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ss18Q62280 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ss18Q62280 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ss18Q62280 Apbb2-216ENSMUST00000162366 6540 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ss18Q62280 AI314180-202ENSMUST00000102889 7045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ss18Q62280 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ss18Q62280 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ss18Q62280 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ss18Q62280 Itpr3-201ENSMUST00000049308 8990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
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Ss18Q62280 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
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Ss18Q62280 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ss18Q62280 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
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Ss18Q62280 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Ss18Q62280 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ss18Q62280 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
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Ss18Q62280 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Ss18Q62280 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
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Ss18Q62280 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
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Ss18Q62280 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ss18Q62280 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
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Ss18Q62280 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
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Ss18Q62280 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
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Ss18Q62280 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
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Ss18Q62280 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ss18Q62280 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ss18Q62280 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ss18Q62280 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ss18Q62280 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ss18Q62280 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
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Ss18Q62280 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ss18Q62280 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ss18Q62280 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ss18Q62280 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ss18Q62280 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ss18Q62280 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ss18Q62280 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ss18Q62280 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ss18Q62280 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ss18Q62280 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ss18Q62280 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ss18Q62280 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ss18Q62280 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ss18Q62280 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ss18Q62280 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ss18Q62280 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Ss18Q62280 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ss18Q62280 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Ss18Q62280 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms