Protein–RNA interactions for Protein: Q61045

Sim1, Single-minded homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 765 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sim1Q61045 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sim1Q61045 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sim1Q61045 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sim1Q61045 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sim1Q61045 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sim1Q61045 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sim1Q61045 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sim1Q61045 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sim1Q61045 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sim1Q61045 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Sim1Q61045 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Sim1Q61045 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Sim1Q61045 1700113H08Rik-202ENSMUST00000189456 974 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sim1Q61045 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sim1Q61045 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Sim1Q61045 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Sim1Q61045 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sim1Q61045 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sim1Q61045 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Sim1Q61045 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sim1Q61045 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sim1Q61045 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sim1Q61045 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sim1Q61045 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sim1Q61045 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Sim1Q61045 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sim1Q61045 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sim1Q61045 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sim1Q61045 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sim1Q61045 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sim1Q61045 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sim1Q61045 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sim1Q61045 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sim1Q61045 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Sim1Q61045 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sim1Q61045 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sim1Q61045 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sim1Q61045 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sim1Q61045 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sim1Q61045 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sim1Q61045 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sim1Q61045 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sim1Q61045 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sim1Q61045 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sim1Q61045 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sim1Q61045 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sim1Q61045 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sim1Q61045 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sim1Q61045 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sim1Q61045 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Sim1Q61045 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sim1Q61045 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sim1Q61045 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sim1Q61045 Gm5940-201ENSMUST00000117582 1068 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Sim1Q61045 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Sim1Q61045 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sim1Q61045 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sim1Q61045 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Sim1Q61045 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Sim1Q61045 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sim1Q61045 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sim1Q61045 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sim1Q61045 Gm7399-201ENSMUST00000032395 858 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Sim1Q61045 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sim1Q61045 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sim1Q61045 Olfr707-201ENSMUST00000088687 924 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sim1Q61045 Olfr1532-ps1-201ENSMUST00000098140 924 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sim1Q61045 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sim1Q61045 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sim1Q61045 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sim1Q61045 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sim1Q61045 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sim1Q61045 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sim1Q61045 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sim1Q61045 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sim1Q61045 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sim1Q61045 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sim1Q61045 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sim1Q61045 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sim1Q61045 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sim1Q61045 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sim1Q61045 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sim1Q61045 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sim1Q61045 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sim1Q61045 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sim1Q61045 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sim1Q61045 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sim1Q61045 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sim1Q61045 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sim1Q61045 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sim1Q61045 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sim1Q61045 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sim1Q61045 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sim1Q61045 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Sim1Q61045 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Sim1Q61045 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sim1Q61045 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sim1Q61045 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sim1Q61045 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sim1Q61045 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.3 ms