Protein–RNA interactions for Protein: Q60980

Klf3, Krueppel-like factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf3Q60980 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Klf3Q60980 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Klf3Q60980 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Klf3Q60980 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Klf3Q60980 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Klf3Q60980 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Klf3Q60980 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Klf3Q60980 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Klf3Q60980 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Klf3Q60980 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Klf3Q60980 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Klf3Q60980 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Klf3Q60980 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Klf3Q60980 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Klf3Q60980 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Klf3Q60980 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Klf3Q60980 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Klf3Q60980 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Klf3Q60980 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Klf3Q60980 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Klf3Q60980 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Klf3Q60980 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Klf3Q60980 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Klf3Q60980 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Klf3Q60980 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Klf3Q60980 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Klf3Q60980 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Klf3Q60980 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Klf3Q60980 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Klf3Q60980 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Klf3Q60980 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Klf3Q60980 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Klf3Q60980 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Klf3Q60980 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Klf3Q60980 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Klf3Q60980 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Klf3Q60980 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Klf3Q60980 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Klf3Q60980 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Klf3Q60980 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Klf3Q60980 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Klf3Q60980 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Klf3Q60980 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Klf3Q60980 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Klf3Q60980 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Klf3Q60980 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Klf3Q60980 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Klf3Q60980 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Klf3Q60980 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Klf3Q60980 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Klf3Q60980 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Klf3Q60980 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Klf3Q60980 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Klf3Q60980 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Klf3Q60980 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Klf3Q60980 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Klf3Q60980 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Klf3Q60980 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Klf3Q60980 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Klf3Q60980 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Klf3Q60980 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Klf3Q60980 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Klf3Q60980 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Klf3Q60980 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Klf3Q60980 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Klf3Q60980 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Klf3Q60980 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Klf3Q60980 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Klf3Q60980 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Klf3Q60980 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Klf3Q60980 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Klf3Q60980 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Klf3Q60980 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Klf3Q60980 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Klf3Q60980 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Klf3Q60980 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Klf3Q60980 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Klf3Q60980 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Klf3Q60980 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Klf3Q60980 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Klf3Q60980 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Klf3Q60980 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Klf3Q60980 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Klf3Q60980 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Klf3Q60980 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Klf3Q60980 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Klf3Q60980 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Klf3Q60980 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Klf3Q60980 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Klf3Q60980 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Klf3Q60980 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Klf3Q60980 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Klf3Q60980 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Klf3Q60980 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Klf3Q60980 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Klf3Q60980 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Klf3Q60980 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Klf3Q60980 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Klf3Q60980 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Klf3Q60980 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78 ms