Protein–RNA interactions for Protein: Q60867

Neurod1, Neurogenic differentiation factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Neurod1Q60867 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Neurod1Q60867 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Neurod1Q60867 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Neurod1Q60867 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Neurod1Q60867 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Neurod1Q60867 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Neurod1Q60867 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Neurod1Q60867 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Neurod1Q60867 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Neurod1Q60867 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Neurod1Q60867 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Neurod1Q60867 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Neurod1Q60867 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Neurod1Q60867 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Neurod1Q60867 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Neurod1Q60867 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Neurod1Q60867 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Neurod1Q60867 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Neurod1Q60867 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Neurod1Q60867 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Neurod1Q60867 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Neurod1Q60867 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Neurod1Q60867 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Neurod1Q60867 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Neurod1Q60867 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Neurod1Q60867 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Neurod1Q60867 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Neurod1Q60867 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Neurod1Q60867 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Neurod1Q60867 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Neurod1Q60867 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Neurod1Q60867 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Neurod1Q60867 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Neurod1Q60867 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Neurod1Q60867 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Neurod1Q60867 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Neurod1Q60867 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Neurod1Q60867 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Neurod1Q60867 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Neurod1Q60867 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Neurod1Q60867 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Neurod1Q60867 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Neurod1Q60867 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Neurod1Q60867 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Neurod1Q60867 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Neurod1Q60867 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Neurod1Q60867 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Neurod1Q60867 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Neurod1Q60867 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Neurod1Q60867 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Neurod1Q60867 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Neurod1Q60867 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Neurod1Q60867 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Neurod1Q60867 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Neurod1Q60867 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Neurod1Q60867 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Neurod1Q60867 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Neurod1Q60867 Dars2-201ENSMUST00000035430 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Neurod1Q60867 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Neurod1Q60867 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Neurod1Q60867 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Neurod1Q60867 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Neurod1Q60867 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Neurod1Q60867 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Neurod1Q60867 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Neurod1Q60867 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Neurod1Q60867 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Neurod1Q60867 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Neurod1Q60867 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Neurod1Q60867 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Neurod1Q60867 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Neurod1Q60867 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Neurod1Q60867 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Neurod1Q60867 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Neurod1Q60867 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Neurod1Q60867 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Neurod1Q60867 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Neurod1Q60867 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Neurod1Q60867 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Neurod1Q60867 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Neurod1Q60867 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Neurod1Q60867 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Neurod1Q60867 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Neurod1Q60867 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Neurod1Q60867 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Neurod1Q60867 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Neurod1Q60867 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Neurod1Q60867 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Neurod1Q60867 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Neurod1Q60867 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Neurod1Q60867 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Neurod1Q60867 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Neurod1Q60867 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Neurod1Q60867 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Neurod1Q60867 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Neurod1Q60867 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Neurod1Q60867 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Neurod1Q60867 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Neurod1Q60867 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Neurod1Q60867 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.7 ms