Protein–RNA interactions for Protein: Q60770

Stxbp3, Syntaxin-binding protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 592 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stxbp3Q60770 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Stxbp3Q60770 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Stxbp3Q60770 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Stxbp3Q60770 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Stxbp3Q60770 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Stxbp3Q60770 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Stxbp3Q60770 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Stxbp3Q60770 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Stxbp3Q60770 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Stxbp3Q60770 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Stxbp3Q60770 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Stxbp3Q60770 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Stxbp3Q60770 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Stxbp3Q60770 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Stxbp3Q60770 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Stxbp3Q60770 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Stxbp3Q60770 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Stxbp3Q60770 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Stxbp3Q60770 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Stxbp3Q60770 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Stxbp3Q60770 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Stxbp3Q60770 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Stxbp3Q60770 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Stxbp3Q60770 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Stxbp3Q60770 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Stxbp3Q60770 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Stxbp3Q60770 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Stxbp3Q60770 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Stxbp3Q60770 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Stxbp3Q60770 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Stxbp3Q60770 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Stxbp3Q60770 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Stxbp3Q60770 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Stxbp3Q60770 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Stxbp3Q60770 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Stxbp3Q60770 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Stxbp3Q60770 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Stxbp3Q60770 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Stxbp3Q60770 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Stxbp3Q60770 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Stxbp3Q60770 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Stxbp3Q60770 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Stxbp3Q60770 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Stxbp3Q60770 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Stxbp3Q60770 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Stxbp3Q60770 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Stxbp3Q60770 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Stxbp3Q60770 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Stxbp3Q60770 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Stxbp3Q60770 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Stxbp3Q60770 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Stxbp3Q60770 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Stxbp3Q60770 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Stxbp3Q60770 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Stxbp3Q60770 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Stxbp3Q60770 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Stxbp3Q60770 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Stxbp3Q60770 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Stxbp3Q60770 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Stxbp3Q60770 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Stxbp3Q60770 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Stxbp3Q60770 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Stxbp3Q60770 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Stxbp3Q60770 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Stxbp3Q60770 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Stxbp3Q60770 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Stxbp3Q60770 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Stxbp3Q60770 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Stxbp3Q60770 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Stxbp3Q60770 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Stxbp3Q60770 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Stxbp3Q60770 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Stxbp3Q60770 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Stxbp3Q60770 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Stxbp3Q60770 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Stxbp3Q60770 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Stxbp3Q60770 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Stxbp3Q60770 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Stxbp3Q60770 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Stxbp3Q60770 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Stxbp3Q60770 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Stxbp3Q60770 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Stxbp3Q60770 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Stxbp3Q60770 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Stxbp3Q60770 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Stxbp3Q60770 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Stxbp3Q60770 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Stxbp3Q60770 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Stxbp3Q60770 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Stxbp3Q60770 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Stxbp3Q60770 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Stxbp3Q60770 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Stxbp3Q60770 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Stxbp3Q60770 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Stxbp3Q60770 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Stxbp3Q60770 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Stxbp3Q60770 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Stxbp3Q60770 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Stxbp3Q60770 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Stxbp3Q60770 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42 ms