Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSW2

Psme4, Proteasome activator complex subunit 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,843 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psme4Q5SSW2 Mitd1-205ENSMUST00000139725 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Psme4Q5SSW2 Gm11961-202ENSMUST00000141157 760 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Psme4Q5SSW2 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Psme4Q5SSW2 H2afz-206ENSMUST00000173790 437 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Psme4Q5SSW2 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Psme4Q5SSW2 Gm10308-201ENSMUST00000095183 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Psme4Q5SSW2 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Psme4Q5SSW2 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Psme4Q5SSW2 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Psme4Q5SSW2 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Psme4Q5SSW2 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Psme4Q5SSW2 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Psme4Q5SSW2 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Psme4Q5SSW2 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Psme4Q5SSW2 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Psme4Q5SSW2 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Psme4Q5SSW2 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Psme4Q5SSW2 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Psme4Q5SSW2 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Psme4Q5SSW2 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Psme4Q5SSW2 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Psme4Q5SSW2 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Psme4Q5SSW2 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Psme4Q5SSW2 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Psme4Q5SSW2 S100a3-204ENSMUST00000200290 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Psme4Q5SSW2 Gm39185-201ENSMUST00000212941 540 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Psme4Q5SSW2 Gm39404-201ENSMUST00000216350 313 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Psme4Q5SSW2 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Psme4Q5SSW2 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Psme4Q5SSW2 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Psme4Q5SSW2 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Psme4Q5SSW2 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Psme4Q5SSW2 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Psme4Q5SSW2 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Psme4Q5SSW2 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Psme4Q5SSW2 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Psme4Q5SSW2 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Psme4Q5SSW2 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Psme4Q5SSW2 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Psme4Q5SSW2 B9d1os-201ENSMUST00000137010 674 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Psme4Q5SSW2 Gm18734-201ENSMUST00000172937 808 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Psme4Q5SSW2 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Psme4Q5SSW2 Prss34-201ENSMUST00000037453 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Psme4Q5SSW2 Tnni3-201ENSMUST00000098859 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Psme4Q5SSW2 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Psme4Q5SSW2 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Psme4Q5SSW2 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Psme4Q5SSW2 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Psme4Q5SSW2 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Psme4Q5SSW2 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Psme4Q5SSW2 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Psme4Q5SSW2 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Psme4Q5SSW2 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Psme4Q5SSW2 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Psme4Q5SSW2 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Psme4Q5SSW2 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Psme4Q5SSW2 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Psme4Q5SSW2 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Psme4Q5SSW2 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Psme4Q5SSW2 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Psme4Q5SSW2 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Psme4Q5SSW2 Gm24749-201ENSMUST00000157838 343 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Psme4Q5SSW2 Gm8018-201ENSMUST00000173536 789 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Psme4Q5SSW2 Gm29787-201ENSMUST00000222129 849 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Psme4Q5SSW2 AC123665.1-201ENSMUST00000228204 438 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Psme4Q5SSW2 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Psme4Q5SSW2 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Psme4Q5SSW2 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Psme4Q5SSW2 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Psme4Q5SSW2 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Psme4Q5SSW2 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Psme4Q5SSW2 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Psme4Q5SSW2 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Psme4Q5SSW2 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Psme4Q5SSW2 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Psme4Q5SSW2 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Psme4Q5SSW2 Gm15326-202ENSMUST00000128198 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Psme4Q5SSW2 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Psme4Q5SSW2 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Psme4Q5SSW2 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Psme4Q5SSW2 Gm16066-201ENSMUST00000118575 1086 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Psme4Q5SSW2 Gng2-205ENSMUST00000161247 419 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Psme4Q5SSW2 Gm3625-201ENSMUST00000170816 102 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Psme4Q5SSW2 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Psme4Q5SSW2 Gm44262-201ENSMUST00000204969 372 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Psme4Q5SSW2 1700112L15Rik-201ENSMUST00000212067 510 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Psme4Q5SSW2 Tmem14a-202ENSMUST00000027065 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Psme4Q5SSW2 Ppie-201ENSMUST00000030404 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Psme4Q5SSW2 Rpl10a-ps2-201ENSMUST00000071184 642 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Psme4Q5SSW2 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Psme4Q5SSW2 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Psme4Q5SSW2 Vmn1r197-201ENSMUST00000091734 897 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Psme4Q5SSW2 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Psme4Q5SSW2 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Psme4Q5SSW2 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Psme4Q5SSW2 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Psme4Q5SSW2 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Psme4Q5SSW2 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Psme4Q5SSW2 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Psme4Q5SSW2 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms