Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSI6

Utp18, U3 small nucleolar RNA-associated protein 18 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Utp18Q5SSI6 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Utp18Q5SSI6 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Utp18Q5SSI6 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Utp18Q5SSI6 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Utp18Q5SSI6 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Utp18Q5SSI6 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Utp18Q5SSI6 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Utp18Q5SSI6 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Utp18Q5SSI6 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Utp18Q5SSI6 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Utp18Q5SSI6 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Utp18Q5SSI6 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Utp18Q5SSI6 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Utp18Q5SSI6 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Utp18Q5SSI6 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Utp18Q5SSI6 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Utp18Q5SSI6 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Utp18Q5SSI6 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Utp18Q5SSI6 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Utp18Q5SSI6 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Utp18Q5SSI6 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Utp18Q5SSI6 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Utp18Q5SSI6 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Utp18Q5SSI6 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Utp18Q5SSI6 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Utp18Q5SSI6 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Utp18Q5SSI6 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Utp18Q5SSI6 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Utp18Q5SSI6 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Utp18Q5SSI6 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Utp18Q5SSI6 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Utp18Q5SSI6 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Utp18Q5SSI6 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Utp18Q5SSI6 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Utp18Q5SSI6 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Utp18Q5SSI6 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Utp18Q5SSI6 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Utp18Q5SSI6 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Utp18Q5SSI6 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Utp18Q5SSI6 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Utp18Q5SSI6 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Utp18Q5SSI6 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Utp18Q5SSI6 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Utp18Q5SSI6 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Utp18Q5SSI6 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Utp18Q5SSI6 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Utp18Q5SSI6 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Utp18Q5SSI6 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Utp18Q5SSI6 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Utp18Q5SSI6 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Utp18Q5SSI6 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Utp18Q5SSI6 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Utp18Q5SSI6 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Utp18Q5SSI6 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Utp18Q5SSI6 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Utp18Q5SSI6 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Utp18Q5SSI6 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Utp18Q5SSI6 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Utp18Q5SSI6 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Utp18Q5SSI6 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Utp18Q5SSI6 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Utp18Q5SSI6 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Utp18Q5SSI6 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Utp18Q5SSI6 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Utp18Q5SSI6 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Utp18Q5SSI6 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Utp18Q5SSI6 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Utp18Q5SSI6 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Utp18Q5SSI6 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Utp18Q5SSI6 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Utp18Q5SSI6 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Utp18Q5SSI6 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Utp18Q5SSI6 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Utp18Q5SSI6 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Utp18Q5SSI6 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Utp18Q5SSI6 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Utp18Q5SSI6 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Utp18Q5SSI6 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Utp18Q5SSI6 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Utp18Q5SSI6 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Utp18Q5SSI6 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Utp18Q5SSI6 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Utp18Q5SSI6 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Utp18Q5SSI6 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Utp18Q5SSI6 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Utp18Q5SSI6 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Utp18Q5SSI6 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Utp18Q5SSI6 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Utp18Q5SSI6 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Utp18Q5SSI6 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Utp18Q5SSI6 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Utp18Q5SSI6 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Utp18Q5SSI6 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Utp18Q5SSI6 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Utp18Q5SSI6 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Utp18Q5SSI6 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Utp18Q5SSI6 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Utp18Q5SSI6 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Utp18Q5SSI6 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Utp18Q5SSI6 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms