Protein–RNA interactions for Protein: Q52KB6

C2cd3, C2 domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 2,323 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C2cd3Q52KB6 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
C2cd3Q52KB6 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
C2cd3Q52KB6 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
C2cd3Q52KB6 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
C2cd3Q52KB6 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
C2cd3Q52KB6 Prss43-201ENSMUST00000077549 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
C2cd3Q52KB6 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
C2cd3Q52KB6 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
C2cd3Q52KB6 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
C2cd3Q52KB6 Gm11961-202ENSMUST00000141157 760 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
C2cd3Q52KB6 Mocs2-205ENSMUST00000165022 962 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
C2cd3Q52KB6 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
C2cd3Q52KB6 Qdpr-209ENSMUST00000198258 1172 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
C2cd3Q52KB6 Ccdc153-202ENSMUST00000213891 792 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
C2cd3Q52KB6 Gm32141-201ENSMUST00000220189 488 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
C2cd3Q52KB6 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
C2cd3Q52KB6 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
C2cd3Q52KB6 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
C2cd3Q52KB6 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
C2cd3Q52KB6 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
C2cd3Q52KB6 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
C2cd3Q52KB6 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
C2cd3Q52KB6 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
C2cd3Q52KB6 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
C2cd3Q52KB6 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
C2cd3Q52KB6 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
C2cd3Q52KB6 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
C2cd3Q52KB6 A230072I06Rik-201ENSMUST00000098935 1839 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
C2cd3Q52KB6 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
C2cd3Q52KB6 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
C2cd3Q52KB6 Pigp-205ENSMUST00000113917 805 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
C2cd3Q52KB6 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
C2cd3Q52KB6 Mitd1-205ENSMUST00000139725 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
C2cd3Q52KB6 2610027F03Rik-202ENSMUST00000186982 603 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
C2cd3Q52KB6 4930404N11Rik-201ENSMUST00000020456 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
C2cd3Q52KB6 Gm7848-201ENSMUST00000210739 718 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
C2cd3Q52KB6 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
C2cd3Q52KB6 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
C2cd3Q52KB6 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
C2cd3Q52KB6 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
C2cd3Q52KB6 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
C2cd3Q52KB6 Tubb4b-ps2-201ENSMUST00000187481 1337 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
C2cd3Q52KB6 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
C2cd3Q52KB6 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
C2cd3Q52KB6 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
C2cd3Q52KB6 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
C2cd3Q52KB6 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
C2cd3Q52KB6 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
C2cd3Q52KB6 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
C2cd3Q52KB6 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
C2cd3Q52KB6 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
C2cd3Q52KB6 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
C2cd3Q52KB6 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
C2cd3Q52KB6 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
C2cd3Q52KB6 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
C2cd3Q52KB6 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
C2cd3Q52KB6 Park7-202ENSMUST00000105673 919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
C2cd3Q52KB6 Tax1bp3-202ENSMUST00000108477 1153 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
C2cd3Q52KB6 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
C2cd3Q52KB6 Ldha-ps2-201ENSMUST00000118722 1057 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
C2cd3Q52KB6 Spx-202ENSMUST00000126521 357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
C2cd3Q52KB6 Nop56-204ENSMUST00000136621 868 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
C2cd3Q52KB6 Bcap31-201ENSMUST00000002091 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
C2cd3Q52KB6 Gm33104-201ENSMUST00000214178 1010 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
C2cd3Q52KB6 Adm2-201ENSMUST00000066991 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
C2cd3Q52KB6 Klk1b27-201ENSMUST00000079859 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
C2cd3Q52KB6 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
C2cd3Q52KB6 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC11.24□□□□□ -0.61
C2cd3Q52KB6 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
C2cd3Q52KB6 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
C2cd3Q52KB6 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
C2cd3Q52KB6 Pitpnb-201ENSMUST00000086635 2761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
C2cd3Q52KB6 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
C2cd3Q52KB6 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
C2cd3Q52KB6 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
C2cd3Q52KB6 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
C2cd3Q52KB6 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
C2cd3Q52KB6 Gm6580-201ENSMUST00000117504 1357 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
C2cd3Q52KB6 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
C2cd3Q52KB6 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
C2cd3Q52KB6 Tulp2-202ENSMUST00000085331 1525 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
C2cd3Q52KB6 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC11.24□□□□□ -0.61
C2cd3Q52KB6 3110056K07Rik-202ENSMUST00000136690 1063 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
C2cd3Q52KB6 Gm28215-201ENSMUST00000186146 346 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
C2cd3Q52KB6 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
C2cd3Q52KB6 AC154176.1-201ENSMUST00000225897 220 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
C2cd3Q52KB6 Tex30-201ENSMUST00000027215 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
C2cd3Q52KB6 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
C2cd3Q52KB6 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
C2cd3Q52KB6 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
C2cd3Q52KB6 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
C2cd3Q52KB6 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
C2cd3Q52KB6 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC11.24□□□□□ -0.61
C2cd3Q52KB6 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
C2cd3Q52KB6 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
C2cd3Q52KB6 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
C2cd3Q52KB6 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
C2cd3Q52KB6 Aire-202ENSMUST00000105395 1630 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
C2cd3Q52KB6 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
C2cd3Q52KB6 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms