Protein–RNA interactions for Protein: Q499D5

Zfp235, Zinc finger protein 235, mousemouse

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Length 702 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp235Q499D5 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Zfp235Q499D5 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Zfp235Q499D5 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Zfp235Q499D5 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Zfp235Q499D5 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Zfp235Q499D5 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Zfp235Q499D5 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Zfp235Q499D5 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Zfp235Q499D5 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Zfp235Q499D5 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Zfp235Q499D5 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Zfp235Q499D5 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
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Zfp235Q499D5 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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Zfp235Q499D5 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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Zfp235Q499D5 Ifi30-202ENSMUST00000222087 981 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Zfp235Q499D5 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Zfp235Q499D5 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Zfp235Q499D5 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Zfp235Q499D5 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Zfp235Q499D5 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Zfp235Q499D5 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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Zfp235Q499D5 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Zfp235Q499D5 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Zfp235Q499D5 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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Zfp235Q499D5 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Zfp235Q499D5 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Zfp235Q499D5 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Zfp235Q499D5 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Zfp235Q499D5 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Zfp235Q499D5 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Zfp235Q499D5 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Zfp235Q499D5 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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Zfp235Q499D5 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Zfp235Q499D5 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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Zfp235Q499D5 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Zfp235Q499D5 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
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Zfp235Q499D5 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Zfp235Q499D5 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
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Zfp235Q499D5 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Zfp235Q499D5 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Zfp235Q499D5 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Zfp235Q499D5 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Zfp235Q499D5 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Zfp235Q499D5 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Zfp235Q499D5 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Zfp235Q499D5 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Zfp235Q499D5 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Zfp235Q499D5 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Zfp235Q499D5 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Zfp235Q499D5 Gm14381-201ENSMUST00000122105 414 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Zfp235Q499D5 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Zfp235Q499D5 Zfp629-204ENSMUST00000128731 823 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Zfp235Q499D5 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Zfp235Q499D5 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Zfp235Q499D5 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Zfp235Q499D5 Gm25261-201ENSMUST00000157416 134 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Zfp235Q499D5 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Zfp235Q499D5 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Zfp235Q499D5 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.7 ms