Protein–RNA interactions for Protein: Q3V118

Ccdc185, Coiled-coil domain-containing 185, mousemouse

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Length 621 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc185Q3V118 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
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Ccdc185Q3V118 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ccdc185Q3V118 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ccdc185Q3V118 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Ccdc185Q3V118 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ccdc185Q3V118 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ccdc185Q3V118 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
Ccdc185Q3V118 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ccdc185Q3V118 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ccdc185Q3V118 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
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Ccdc185Q3V118 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
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Ccdc185Q3V118 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ccdc185Q3V118 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
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Ccdc185Q3V118 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
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Ccdc185Q3V118 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
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Ccdc185Q3V118 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ccdc185Q3V118 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ccdc185Q3V118 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
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Ccdc185Q3V118 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ccdc185Q3V118 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ccdc185Q3V118 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
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Ccdc185Q3V118 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ccdc185Q3V118 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ccdc185Q3V118 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Ccdc185Q3V118 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ccdc185Q3V118 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Ccdc185Q3V118 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ccdc185Q3V118 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
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Ccdc185Q3V118 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
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Ccdc185Q3V118 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ccdc185Q3V118 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ccdc185Q3V118 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ccdc185Q3V118 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
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