Protein–RNA interactions for Protein: Q3V089

Rbm44, RNA-binding protein 44, mousemouse

Predictions only

Length 1,013 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbm44Q3V089 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rbm44Q3V089 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rbm44Q3V089 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rbm44Q3V089 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Rbm44Q3V089 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rbm44Q3V089 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Rbm44Q3V089 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rbm44Q3V089 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rbm44Q3V089 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rbm44Q3V089 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rbm44Q3V089 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rbm44Q3V089 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rbm44Q3V089 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rbm44Q3V089 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rbm44Q3V089 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rbm44Q3V089 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rbm44Q3V089 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rbm44Q3V089 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rbm44Q3V089 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rbm44Q3V089 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rbm44Q3V089 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rbm44Q3V089 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rbm44Q3V089 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rbm44Q3V089 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
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Rbm44Q3V089 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rbm44Q3V089 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rbm44Q3V089 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rbm44Q3V089 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rbm44Q3V089 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Rbm44Q3V089 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Rbm44Q3V089 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Rbm44Q3V089 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC13.27□□□□□ -0.28
Rbm44Q3V089 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Rbm44Q3V089 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Rbm44Q3V089 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Rbm44Q3V089 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Rbm44Q3V089 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
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Rbm44Q3V089 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Rbm44Q3V089 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rbm44Q3V089 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rbm44Q3V089 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.29
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Rbm44Q3V089 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
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Rbm44Q3V089 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
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Rbm44Q3V089 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rbm44Q3V089 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
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Rbm44Q3V089 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rbm44Q3V089 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
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Rbm44Q3V089 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
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Rbm44Q3V089 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rbm44Q3V089 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rbm44Q3V089 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
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Rbm44Q3V089 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rbm44Q3V089 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
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Rbm44Q3V089 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rbm44Q3V089 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rbm44Q3V089 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rbm44Q3V089 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rbm44Q3V089 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rbm44Q3V089 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rbm44Q3V089 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rbm44Q3V089 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rbm44Q3V089 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Rbm44Q3V089 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rbm44Q3V089 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rbm44Q3V089 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rbm44Q3V089 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rbm44Q3V089 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
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Rbm44Q3V089 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rbm44Q3V089 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rbm44Q3V089 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rbm44Q3V089 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
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