Protein–RNA interactions for Protein: Q3V038

Ttc9, Tetratricopeptide repeat protein 9A, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc9Q3V038 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ttc9Q3V038 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ttc9Q3V038 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ttc9Q3V038 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ttc9Q3V038 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ttc9Q3V038 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ttc9Q3V038 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ttc9Q3V038 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ttc9Q3V038 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ttc9Q3V038 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ttc9Q3V038 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ttc9Q3V038 Armc2-208ENSMUST00000162405 1135 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ttc9Q3V038 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ttc9Q3V038 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ttc9Q3V038 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ttc9Q3V038 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Ttc9Q3V038 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ttc9Q3V038 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ttc9Q3V038 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ttc9Q3V038 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ttc9Q3V038 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ttc9Q3V038 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ttc9Q3V038 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ttc9Q3V038 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Ttc9Q3V038 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ttc9Q3V038 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ttc9Q3V038 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ttc9Q3V038 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ttc9Q3V038 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ttc9Q3V038 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ttc9Q3V038 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ttc9Q3V038 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ttc9Q3V038 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ttc9Q3V038 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ttc9Q3V038 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ttc9Q3V038 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ttc9Q3V038 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ttc9Q3V038 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ttc9Q3V038 Hemk1-202ENSMUST00000118051 453 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ttc9Q3V038 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ttc9Q3V038 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ttc9Q3V038 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Ttc9Q3V038 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ttc9Q3V038 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ttc9Q3V038 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ttc9Q3V038 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ttc9Q3V038 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Ttc9Q3V038 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Ttc9Q3V038 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ttc9Q3V038 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ttc9Q3V038 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ttc9Q3V038 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ttc9Q3V038 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ttc9Q3V038 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ttc9Q3V038 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ttc9Q3V038 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ttc9Q3V038 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Ttc9Q3V038 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ttc9Q3V038 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ttc9Q3V038 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ttc9Q3V038 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ttc9Q3V038 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ttc9Q3V038 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ttc9Q3V038 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ttc9Q3V038 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ttc9Q3V038 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ttc9Q3V038 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ttc9Q3V038 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ttc9Q3V038 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ttc9Q3V038 Gm14723-201ENSMUST00000118686 215 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Ttc9Q3V038 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ttc9Q3V038 Gm4857-201ENSMUST00000192718 785 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Ttc9Q3V038 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Ttc9Q3V038 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Ttc9Q3V038 AC164612.1-201ENSMUST00000216699 517 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ttc9Q3V038 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ttc9Q3V038 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ttc9Q3V038 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ttc9Q3V038 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ttc9Q3V038 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ttc9Q3V038 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ttc9Q3V038 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ttc9Q3V038 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ttc9Q3V038 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ttc9Q3V038 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ttc9Q3V038 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ttc9Q3V038 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ttc9Q3V038 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ttc9Q3V038 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ttc9Q3V038 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ttc9Q3V038 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ttc9Q3V038 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Ttc9Q3V038 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Ttc9Q3V038 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ttc9Q3V038 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ttc9Q3V038 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ttc9Q3V038 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ttc9Q3V038 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ttc9Q3V038 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ttc9Q3V038 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.9 ms