Protein–RNA interactions for Protein: Q3UZ01

Rnpc3, RNA-binding protein 40, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 514 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnpc3Q3UZ01 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rnpc3Q3UZ01 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rnpc3Q3UZ01 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rnpc3Q3UZ01 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rnpc3Q3UZ01 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rnpc3Q3UZ01 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rnpc3Q3UZ01 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Rnpc3Q3UZ01 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rnpc3Q3UZ01 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rnpc3Q3UZ01 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rnpc3Q3UZ01 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rnpc3Q3UZ01 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rnpc3Q3UZ01 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rnpc3Q3UZ01 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rnpc3Q3UZ01 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rnpc3Q3UZ01 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rnpc3Q3UZ01 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rnpc3Q3UZ01 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rnpc3Q3UZ01 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rnpc3Q3UZ01 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Rnpc3Q3UZ01 Armc2-208ENSMUST00000162405 1135 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rnpc3Q3UZ01 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Rnpc3Q3UZ01 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rnpc3Q3UZ01 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Rnpc3Q3UZ01 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rnpc3Q3UZ01 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rnpc3Q3UZ01 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rnpc3Q3UZ01 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Rnpc3Q3UZ01 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rnpc3Q3UZ01 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rnpc3Q3UZ01 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rnpc3Q3UZ01 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rnpc3Q3UZ01 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rnpc3Q3UZ01 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rnpc3Q3UZ01 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rnpc3Q3UZ01 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rnpc3Q3UZ01 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rnpc3Q3UZ01 Ablim2-203ENSMUST00000114203 1333 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rnpc3Q3UZ01 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Rnpc3Q3UZ01 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rnpc3Q3UZ01 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rnpc3Q3UZ01 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rnpc3Q3UZ01 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rnpc3Q3UZ01 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rnpc3Q3UZ01 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rnpc3Q3UZ01 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rnpc3Q3UZ01 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rnpc3Q3UZ01 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rnpc3Q3UZ01 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rnpc3Q3UZ01 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rnpc3Q3UZ01 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rnpc3Q3UZ01 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rnpc3Q3UZ01 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rnpc3Q3UZ01 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rnpc3Q3UZ01 AC131777.1-201ENSMUST00000214749 387 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rnpc3Q3UZ01 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rnpc3Q3UZ01 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rnpc3Q3UZ01 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rnpc3Q3UZ01 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rnpc3Q3UZ01 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rnpc3Q3UZ01 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rnpc3Q3UZ01 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rnpc3Q3UZ01 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rnpc3Q3UZ01 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rnpc3Q3UZ01 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rnpc3Q3UZ01 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rnpc3Q3UZ01 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Rnpc3Q3UZ01 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rnpc3Q3UZ01 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rnpc3Q3UZ01 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rnpc3Q3UZ01 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rnpc3Q3UZ01 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rnpc3Q3UZ01 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rnpc3Q3UZ01 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rnpc3Q3UZ01 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rnpc3Q3UZ01 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rnpc3Q3UZ01 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rnpc3Q3UZ01 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rnpc3Q3UZ01 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rnpc3Q3UZ01 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rnpc3Q3UZ01 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rnpc3Q3UZ01 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rnpc3Q3UZ01 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Rnpc3Q3UZ01 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rnpc3Q3UZ01 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rnpc3Q3UZ01 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Rnpc3Q3UZ01 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rnpc3Q3UZ01 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rnpc3Q3UZ01 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rnpc3Q3UZ01 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rnpc3Q3UZ01 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Rnpc3Q3UZ01 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rnpc3Q3UZ01 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rnpc3Q3UZ01 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rnpc3Q3UZ01 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rnpc3Q3UZ01 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rnpc3Q3UZ01 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rnpc3Q3UZ01 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rnpc3Q3UZ01 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rnpc3Q3UZ01 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.1 ms