Protein–RNA interactions for Protein: Q3UW13

D130052B06Rik, RIKEN cDNA D130052B06 gene, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D130052B06RikQ3UW13 Cep250-202ENSMUST00000094421 7919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
D130052B06RikQ3UW13 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
D130052B06RikQ3UW13 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
D130052B06RikQ3UW13 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
D130052B06RikQ3UW13 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
D130052B06RikQ3UW13 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
D130052B06RikQ3UW13 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
D130052B06RikQ3UW13 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
D130052B06RikQ3UW13 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
D130052B06RikQ3UW13 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.33□□□□□ -0.92
D130052B06RikQ3UW13 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.33□□□□□ -0.92
D130052B06RikQ3UW13 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
D130052B06RikQ3UW13 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
D130052B06RikQ3UW13 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
D130052B06RikQ3UW13 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
D130052B06RikQ3UW13 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
D130052B06RikQ3UW13 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
D130052B06RikQ3UW13 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
D130052B06RikQ3UW13 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
D130052B06RikQ3UW13 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
D130052B06RikQ3UW13 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
D130052B06RikQ3UW13 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC9.33□□□□□ -0.92
D130052B06RikQ3UW13 Gm43075-201ENSMUST00000198613 3905 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
D130052B06RikQ3UW13 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
D130052B06RikQ3UW13 Esrp1-204ENSMUST00000108313 3696 ntTSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
D130052B06RikQ3UW13 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
D130052B06RikQ3UW13 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
D130052B06RikQ3UW13 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
D130052B06RikQ3UW13 Myo9b-202ENSMUST00000168839 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
D130052B06RikQ3UW13 Mapk8ip3-202ENSMUST00000115228 5424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
D130052B06RikQ3UW13 Pcsk7-201ENSMUST00000039059 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
D130052B06RikQ3UW13 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
D130052B06RikQ3UW13 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
D130052B06RikQ3UW13 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
D130052B06RikQ3UW13 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
D130052B06RikQ3UW13 Hdac7-205ENSMUST00000118294 4069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
D130052B06RikQ3UW13 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
D130052B06RikQ3UW13 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
D130052B06RikQ3UW13 Crybg3-201ENSMUST00000044604 5231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
D130052B06RikQ3UW13 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
D130052B06RikQ3UW13 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
D130052B06RikQ3UW13 Clpb-201ENSMUST00000001884 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
D130052B06RikQ3UW13 Apc-203ENSMUST00000115781 12346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
D130052B06RikQ3UW13 Gm16582-201ENSMUST00000159627 1930 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
D130052B06RikQ3UW13 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
D130052B06RikQ3UW13 Gtf2i-202ENSMUST00000082057 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
D130052B06RikQ3UW13 Slc39a8-205ENSMUST00000167390 3533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
D130052B06RikQ3UW13 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
D130052B06RikQ3UW13 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
D130052B06RikQ3UW13 Myo15-202ENSMUST00000081823 7953 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
D130052B06RikQ3UW13 Lamb3-209ENSMUST00000194677 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
D130052B06RikQ3UW13 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
D130052B06RikQ3UW13 Tcp10b-202ENSMUST00000116666 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
D130052B06RikQ3UW13 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
D130052B06RikQ3UW13 Rasgef1a-202ENSMUST00000203482 2227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
D130052B06RikQ3UW13 Pcdhb19-201ENSMUST00000059571 7138 ntAPPRIS P1 BASIC9.32□□□□□ -0.92
D130052B06RikQ3UW13 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
D130052B06RikQ3UW13 Ap1g2-201ENSMUST00000036041 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
D130052B06RikQ3UW13 Fam60a-201ENSMUST00000054080 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
D130052B06RikQ3UW13 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
D130052B06RikQ3UW13 Smarca2-216ENSMUST00000176769 5703 ntTSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
D130052B06RikQ3UW13 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
D130052B06RikQ3UW13 Nup62cl-201ENSMUST00000101212 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
D130052B06RikQ3UW13 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
D130052B06RikQ3UW13 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
D130052B06RikQ3UW13 Mical3-217ENSMUST00000207889 9204 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
D130052B06RikQ3UW13 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
D130052B06RikQ3UW13 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
D130052B06RikQ3UW13 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC9.32□□□□□ -0.92
D130052B06RikQ3UW13 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
D130052B06RikQ3UW13 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
D130052B06RikQ3UW13 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC9.32□□□□□ -0.92
D130052B06RikQ3UW13 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.32□□□□□ -0.92
D130052B06RikQ3UW13 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
D130052B06RikQ3UW13 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
D130052B06RikQ3UW13 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
D130052B06RikQ3UW13 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
D130052B06RikQ3UW13 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC9.32□□□□□ -0.92
D130052B06RikQ3UW13 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
D130052B06RikQ3UW13 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
D130052B06RikQ3UW13 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC9.32□□□□□ -0.92
D130052B06RikQ3UW13 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
D130052B06RikQ3UW13 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
D130052B06RikQ3UW13 Utp23-203ENSMUST00000137116 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
D130052B06RikQ3UW13 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
D130052B06RikQ3UW13 Gm26678-201ENSMUST00000181057 3025 ntTSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
D130052B06RikQ3UW13 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
D130052B06RikQ3UW13 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC9.32□□□□□ -0.92
D130052B06RikQ3UW13 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
D130052B06RikQ3UW13 Vcan-202ENSMUST00000109544 5702 ntTSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
D130052B06RikQ3UW13 Tepsin-202ENSMUST00000093901 2770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
D130052B06RikQ3UW13 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
D130052B06RikQ3UW13 Nipbl-201ENSMUST00000052965 8815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
D130052B06RikQ3UW13 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC9.32□□□□□ -0.92
D130052B06RikQ3UW13 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
D130052B06RikQ3UW13 Lmna-201ENSMUST00000029699 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
D130052B06RikQ3UW13 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
D130052B06RikQ3UW13 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
D130052B06RikQ3UW13 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
D130052B06RikQ3UW13 Acoxl-201ENSMUST00000028859 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.7 ms