Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPR8

D13Ertd608e, D13Ertd608e protein, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D13Ertd608eQ3UPR8 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
D13Ertd608eQ3UPR8 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
D13Ertd608eQ3UPR8 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
D13Ertd608eQ3UPR8 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
D13Ertd608eQ3UPR8 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
D13Ertd608eQ3UPR8 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
D13Ertd608eQ3UPR8 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
D13Ertd608eQ3UPR8 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
D13Ertd608eQ3UPR8 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
D13Ertd608eQ3UPR8 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
D13Ertd608eQ3UPR8 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
D13Ertd608eQ3UPR8 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
D13Ertd608eQ3UPR8 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
D13Ertd608eQ3UPR8 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
D13Ertd608eQ3UPR8 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
D13Ertd608eQ3UPR8 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
D13Ertd608eQ3UPR8 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
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D13Ertd608eQ3UPR8 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
D13Ertd608eQ3UPR8 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
D13Ertd608eQ3UPR8 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
D13Ertd608eQ3UPR8 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
D13Ertd608eQ3UPR8 Spast-201ENSMUST00000024869 4672 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
D13Ertd608eQ3UPR8 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
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D13Ertd608eQ3UPR8 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC12.43□□□□□ -0.42
D13Ertd608eQ3UPR8 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC12.43□□□□□ -0.42
D13Ertd608eQ3UPR8 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
D13Ertd608eQ3UPR8 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
D13Ertd608eQ3UPR8 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
D13Ertd608eQ3UPR8 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
D13Ertd608eQ3UPR8 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
D13Ertd608eQ3UPR8 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
D13Ertd608eQ3UPR8 Nsun7-204ENSMUST00000202994 3632 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
D13Ertd608eQ3UPR8 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
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D13Ertd608eQ3UPR8 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
D13Ertd608eQ3UPR8 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
D13Ertd608eQ3UPR8 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
D13Ertd608eQ3UPR8 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
D13Ertd608eQ3UPR8 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
D13Ertd608eQ3UPR8 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
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D13Ertd608eQ3UPR8 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
D13Ertd608eQ3UPR8 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
D13Ertd608eQ3UPR8 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
D13Ertd608eQ3UPR8 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
D13Ertd608eQ3UPR8 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
D13Ertd608eQ3UPR8 Amer2-201ENSMUST00000022561 10506 ntAPPRIS P1 BASIC12.42□□□□□ -0.42
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D13Ertd608eQ3UPR8 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
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D13Ertd608eQ3UPR8 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
D13Ertd608eQ3UPR8 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
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D13Ertd608eQ3UPR8 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
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D13Ertd608eQ3UPR8 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
D13Ertd608eQ3UPR8 Calu-206ENSMUST00000172974 3063 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
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D13Ertd608eQ3UPR8 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
D13Ertd608eQ3UPR8 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
D13Ertd608eQ3UPR8 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
D13Ertd608eQ3UPR8 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
D13Ertd608eQ3UPR8 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
D13Ertd608eQ3UPR8 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
D13Ertd608eQ3UPR8 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
D13Ertd608eQ3UPR8 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
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D13Ertd608eQ3UPR8 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
D13Ertd608eQ3UPR8 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
D13Ertd608eQ3UPR8 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
D13Ertd608eQ3UPR8 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
D13Ertd608eQ3UPR8 Wnt7b-202ENSMUST00000109424 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
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D13Ertd608eQ3UPR8 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
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