Protein–RNA interactions for Protein: Q3UDK1

Trafd1, TRAF-type zinc finger domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trafd1Q3UDK1 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trafd1Q3UDK1 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trafd1Q3UDK1 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trafd1Q3UDK1 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trafd1Q3UDK1 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trafd1Q3UDK1 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trafd1Q3UDK1 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trafd1Q3UDK1 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trafd1Q3UDK1 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trafd1Q3UDK1 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trafd1Q3UDK1 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Trafd1Q3UDK1 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Trafd1Q3UDK1 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Trafd1Q3UDK1 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Trafd1Q3UDK1 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Trafd1Q3UDK1 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trafd1Q3UDK1 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trafd1Q3UDK1 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trafd1Q3UDK1 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trafd1Q3UDK1 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trafd1Q3UDK1 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trafd1Q3UDK1 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trafd1Q3UDK1 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trafd1Q3UDK1 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trafd1Q3UDK1 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trafd1Q3UDK1 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trafd1Q3UDK1 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trafd1Q3UDK1 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trafd1Q3UDK1 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trafd1Q3UDK1 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Trafd1Q3UDK1 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trafd1Q3UDK1 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Trafd1Q3UDK1 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trafd1Q3UDK1 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Trafd1Q3UDK1 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trafd1Q3UDK1 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Trafd1Q3UDK1 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trafd1Q3UDK1 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trafd1Q3UDK1 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Trafd1Q3UDK1 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trafd1Q3UDK1 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trafd1Q3UDK1 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trafd1Q3UDK1 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trafd1Q3UDK1 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trafd1Q3UDK1 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trafd1Q3UDK1 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trafd1Q3UDK1 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trafd1Q3UDK1 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trafd1Q3UDK1 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trafd1Q3UDK1 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trafd1Q3UDK1 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trafd1Q3UDK1 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trafd1Q3UDK1 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trafd1Q3UDK1 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trafd1Q3UDK1 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trafd1Q3UDK1 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trafd1Q3UDK1 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Trafd1Q3UDK1 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Trafd1Q3UDK1 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trafd1Q3UDK1 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trafd1Q3UDK1 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trafd1Q3UDK1 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trafd1Q3UDK1 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trafd1Q3UDK1 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trafd1Q3UDK1 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Trafd1Q3UDK1 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Trafd1Q3UDK1 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trafd1Q3UDK1 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trafd1Q3UDK1 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Trafd1Q3UDK1 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Trafd1Q3UDK1 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Trafd1Q3UDK1 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Trafd1Q3UDK1 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trafd1Q3UDK1 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Trafd1Q3UDK1 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trafd1Q3UDK1 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Trafd1Q3UDK1 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Trafd1Q3UDK1 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trafd1Q3UDK1 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Trafd1Q3UDK1 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trafd1Q3UDK1 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trafd1Q3UDK1 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trafd1Q3UDK1 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trafd1Q3UDK1 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trafd1Q3UDK1 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trafd1Q3UDK1 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trafd1Q3UDK1 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Trafd1Q3UDK1 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trafd1Q3UDK1 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trafd1Q3UDK1 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trafd1Q3UDK1 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trafd1Q3UDK1 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trafd1Q3UDK1 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trafd1Q3UDK1 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trafd1Q3UDK1 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trafd1Q3UDK1 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trafd1Q3UDK1 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Trafd1Q3UDK1 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trafd1Q3UDK1 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trafd1Q3UDK1 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.2 ms