Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2S4

Otud5, OTU domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 566 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otud5Q3U2S4 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Otud5Q3U2S4 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Otud5Q3U2S4 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Otud5Q3U2S4 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Otud5Q3U2S4 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Otud5Q3U2S4 Fam110a-202ENSMUST00000109863 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Otud5Q3U2S4 Gm12997-201ENSMUST00000120207 640 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Otud5Q3U2S4 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Otud5Q3U2S4 C030017D09Rik-201ENSMUST00000163690 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Otud5Q3U2S4 Ly6g5b-202ENSMUST00000172854 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Otud5Q3U2S4 Pagr1b-201ENSMUST00000172958 693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Otud5Q3U2S4 Gm11523-203ENSMUST00000184482 802 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Otud5Q3U2S4 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Otud5Q3U2S4 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Otud5Q3U2S4 Erg28-201ENSMUST00000021676 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Otud5Q3U2S4 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Otud5Q3U2S4 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Otud5Q3U2S4 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Otud5Q3U2S4 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Otud5Q3U2S4 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Otud5Q3U2S4 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Otud5Q3U2S4 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Otud5Q3U2S4 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Otud5Q3U2S4 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Otud5Q3U2S4 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Otud5Q3U2S4 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Otud5Q3U2S4 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Otud5Q3U2S4 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Otud5Q3U2S4 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Otud5Q3U2S4 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Otud5Q3U2S4 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Otud5Q3U2S4 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Otud5Q3U2S4 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Otud5Q3U2S4 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Otud5Q3U2S4 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Otud5Q3U2S4 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Otud5Q3U2S4 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Otud5Q3U2S4 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Otud5Q3U2S4 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Otud5Q3U2S4 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Otud5Q3U2S4 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Otud5Q3U2S4 Gm11210-201ENSMUST00000150203 422 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Otud5Q3U2S4 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Otud5Q3U2S4 Gm3402-201ENSMUST00000036715 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Otud5Q3U2S4 4930442H23Rik-201ENSMUST00000056086 1245 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Otud5Q3U2S4 Gm5773-201ENSMUST00000090853 1143 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Otud5Q3U2S4 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Otud5Q3U2S4 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Otud5Q3U2S4 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Otud5Q3U2S4 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Otud5Q3U2S4 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Otud5Q3U2S4 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Otud5Q3U2S4 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Otud5Q3U2S4 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Otud5Q3U2S4 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Otud5Q3U2S4 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Otud5Q3U2S4 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Otud5Q3U2S4 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Otud5Q3U2S4 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Otud5Q3U2S4 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Otud5Q3U2S4 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Otud5Q3U2S4 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Otud5Q3U2S4 Ewsr1-201ENSMUST00000063232 1320 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Otud5Q3U2S4 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Otud5Q3U2S4 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Otud5Q3U2S4 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Otud5Q3U2S4 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Otud5Q3U2S4 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Otud5Q3U2S4 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Otud5Q3U2S4 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Otud5Q3U2S4 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Otud5Q3U2S4 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Otud5Q3U2S4 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Otud5Q3U2S4 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Otud5Q3U2S4 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Otud5Q3U2S4 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Otud5Q3U2S4 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Otud5Q3U2S4 Fundc1-204ENSMUST00000176638 448 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Otud5Q3U2S4 Mospd4-201ENSMUST00000180618 576 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Otud5Q3U2S4 Gm4819-201ENSMUST00000182170 1009 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Otud5Q3U2S4 Gm28085-201ENSMUST00000189281 1137 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Otud5Q3U2S4 AC155637.1-201ENSMUST00000218560 636 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Otud5Q3U2S4 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Otud5Q3U2S4 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Otud5Q3U2S4 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Otud5Q3U2S4 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Otud5Q3U2S4 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Otud5Q3U2S4 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Otud5Q3U2S4 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Otud5Q3U2S4 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Otud5Q3U2S4 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Otud5Q3U2S4 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Otud5Q3U2S4 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Otud5Q3U2S4 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Otud5Q3U2S4 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Otud5Q3U2S4 Myh10-204ENSMUST00000108673 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Otud5Q3U2S4 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Otud5Q3U2S4 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Otud5Q3U2S4 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Otud5Q3U2S4 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms