Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2K5

Kdm4d, Lysine-specific demethylase 4D, mousemouse

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Length 510 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm4dQ3U2K5 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Kdm4dQ3U2K5 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Kdm4dQ3U2K5 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Kdm4dQ3U2K5 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Kdm4dQ3U2K5 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Kdm4dQ3U2K5 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Kdm4dQ3U2K5 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Kdm4dQ3U2K5 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Kdm4dQ3U2K5 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Kdm4dQ3U2K5 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Kdm4dQ3U2K5 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Kdm4dQ3U2K5 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Kdm4dQ3U2K5 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Kdm4dQ3U2K5 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Kdm4dQ3U2K5 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Kdm4dQ3U2K5 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Kdm4dQ3U2K5 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Kdm4dQ3U2K5 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Kdm4dQ3U2K5 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Kdm4dQ3U2K5 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Kdm4dQ3U2K5 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Kdm4dQ3U2K5 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Kdm4dQ3U2K5 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Kdm4dQ3U2K5 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Kdm4dQ3U2K5 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Kdm4dQ3U2K5 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Kdm4dQ3U2K5 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Kdm4dQ3U2K5 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Kdm4dQ3U2K5 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Kdm4dQ3U2K5 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Kdm4dQ3U2K5 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Kdm4dQ3U2K5 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Kdm4dQ3U2K5 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Kdm4dQ3U2K5 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Kdm4dQ3U2K5 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Kdm4dQ3U2K5 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Kdm4dQ3U2K5 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Kdm4dQ3U2K5 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Kdm4dQ3U2K5 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Kdm4dQ3U2K5 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Kdm4dQ3U2K5 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Kdm4dQ3U2K5 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Kdm4dQ3U2K5 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Kdm4dQ3U2K5 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Kdm4dQ3U2K5 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Kdm4dQ3U2K5 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Kdm4dQ3U2K5 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Kdm4dQ3U2K5 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Kdm4dQ3U2K5 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Kdm4dQ3U2K5 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Kdm4dQ3U2K5 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Kdm4dQ3U2K5 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Kdm4dQ3U2K5 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Kdm4dQ3U2K5 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Kdm4dQ3U2K5 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Kdm4dQ3U2K5 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Kdm4dQ3U2K5 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Kdm4dQ3U2K5 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Kdm4dQ3U2K5 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Kdm4dQ3U2K5 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Kdm4dQ3U2K5 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Kdm4dQ3U2K5 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
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Kdm4dQ3U2K5 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
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Kdm4dQ3U2K5 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Kdm4dQ3U2K5 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Kdm4dQ3U2K5 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Kdm4dQ3U2K5 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Kdm4dQ3U2K5 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Kdm4dQ3U2K5 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Kdm4dQ3U2K5 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Kdm4dQ3U2K5 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Kdm4dQ3U2K5 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Kdm4dQ3U2K5 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Kdm4dQ3U2K5 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Kdm4dQ3U2K5 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Kdm4dQ3U2K5 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Kdm4dQ3U2K5 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Kdm4dQ3U2K5 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Kdm4dQ3U2K5 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Kdm4dQ3U2K5 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Kdm4dQ3U2K5 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Kdm4dQ3U2K5 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Kdm4dQ3U2K5 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Kdm4dQ3U2K5 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Kdm4dQ3U2K5 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Kdm4dQ3U2K5 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Kdm4dQ3U2K5 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Kdm4dQ3U2K5 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Kdm4dQ3U2K5 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Kdm4dQ3U2K5 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Kdm4dQ3U2K5 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Kdm4dQ3U2K5 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Kdm4dQ3U2K5 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Kdm4dQ3U2K5 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Kdm4dQ3U2K5 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms