Protein–RNA interactions for Protein: Q3U155

Ccdc174, Coiled-coil domain-containing protein 174, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc174Q3U155 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc174Q3U155 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc174Q3U155 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc174Q3U155 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc174Q3U155 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc174Q3U155 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc174Q3U155 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc174Q3U155 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc174Q3U155 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc174Q3U155 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc174Q3U155 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc174Q3U155 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc174Q3U155 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc174Q3U155 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc174Q3U155 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc174Q3U155 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc174Q3U155 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc174Q3U155 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc174Q3U155 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc174Q3U155 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc174Q3U155 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc174Q3U155 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc174Q3U155 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc174Q3U155 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc174Q3U155 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc174Q3U155 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc174Q3U155 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc174Q3U155 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc174Q3U155 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc174Q3U155 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc174Q3U155 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc174Q3U155 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc174Q3U155 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc174Q3U155 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc174Q3U155 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc174Q3U155 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc174Q3U155 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc174Q3U155 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc174Q3U155 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc174Q3U155 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc174Q3U155 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc174Q3U155 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc174Q3U155 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc174Q3U155 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc174Q3U155 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc174Q3U155 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc174Q3U155 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc174Q3U155 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc174Q3U155 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc174Q3U155 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc174Q3U155 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc174Q3U155 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc174Q3U155 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc174Q3U155 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc174Q3U155 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc174Q3U155 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc174Q3U155 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc174Q3U155 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc174Q3U155 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc174Q3U155 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc174Q3U155 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc174Q3U155 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc174Q3U155 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc174Q3U155 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc174Q3U155 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc174Q3U155 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc174Q3U155 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc174Q3U155 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc174Q3U155 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc174Q3U155 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc174Q3U155 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc174Q3U155 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc174Q3U155 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc174Q3U155 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc174Q3U155 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc174Q3U155 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc174Q3U155 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc174Q3U155 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc174Q3U155 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc174Q3U155 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc174Q3U155 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc174Q3U155 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc174Q3U155 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc174Q3U155 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc174Q3U155 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc174Q3U155 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc174Q3U155 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc174Q3U155 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc174Q3U155 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc174Q3U155 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc174Q3U155 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc174Q3U155 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc174Q3U155 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc174Q3U155 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc174Q3U155 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc174Q3U155 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc174Q3U155 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc174Q3U155 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc174Q3U155 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc174Q3U155 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.4 ms