Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0V2

Tradd, Tumor necrosis factor receptor type 1-associated DEATH domain protein, mousemouse

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Length 310 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TraddQ3U0V2 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
TraddQ3U0V2 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
TraddQ3U0V2 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
TraddQ3U0V2 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
TraddQ3U0V2 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
TraddQ3U0V2 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
TraddQ3U0V2 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
TraddQ3U0V2 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
TraddQ3U0V2 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
TraddQ3U0V2 Nupl1-206ENSMUST00000225111 2936 ntBASIC13.52□□□□□ -0.24
TraddQ3U0V2 CT025678.1-201ENSMUST00000214795 2972 ntBASIC13.52□□□□□ -0.24
TraddQ3U0V2 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
TraddQ3U0V2 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
TraddQ3U0V2 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
TraddQ3U0V2 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
TraddQ3U0V2 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
TraddQ3U0V2 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
TraddQ3U0V2 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
TraddQ3U0V2 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
TraddQ3U0V2 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
TraddQ3U0V2 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
TraddQ3U0V2 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
TraddQ3U0V2 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
TraddQ3U0V2 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
TraddQ3U0V2 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
TraddQ3U0V2 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
TraddQ3U0V2 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
TraddQ3U0V2 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
TraddQ3U0V2 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
TraddQ3U0V2 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
TraddQ3U0V2 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
TraddQ3U0V2 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
TraddQ3U0V2 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
TraddQ3U0V2 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
TraddQ3U0V2 Gm18263-201ENSMUST00000220846 1928 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
TraddQ3U0V2 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
TraddQ3U0V2 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
TraddQ3U0V2 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
TraddQ3U0V2 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
TraddQ3U0V2 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
TraddQ3U0V2 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
TraddQ3U0V2 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
TraddQ3U0V2 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
TraddQ3U0V2 Itfg2-203ENSMUST00000142615 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
TraddQ3U0V2 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
TraddQ3U0V2 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
TraddQ3U0V2 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
TraddQ3U0V2 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
TraddQ3U0V2 Fam234b-202ENSMUST00000111916 2927 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TraddQ3U0V2 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TraddQ3U0V2 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TraddQ3U0V2 CT009757.3-201ENSMUST00000223367 2320 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
TraddQ3U0V2 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TraddQ3U0V2 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TraddQ3U0V2 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
TraddQ3U0V2 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
TraddQ3U0V2 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TraddQ3U0V2 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TraddQ3U0V2 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TraddQ3U0V2 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
TraddQ3U0V2 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TraddQ3U0V2 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TraddQ3U0V2 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TraddQ3U0V2 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
TraddQ3U0V2 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TraddQ3U0V2 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TraddQ3U0V2 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TraddQ3U0V2 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TraddQ3U0V2 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
TraddQ3U0V2 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
TraddQ3U0V2 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TraddQ3U0V2 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
TraddQ3U0V2 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TraddQ3U0V2 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TraddQ3U0V2 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TraddQ3U0V2 Dnajc12-201ENSMUST00000043317 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TraddQ3U0V2 Ccpg1-208ENSMUST00000150826 2939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TraddQ3U0V2 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TraddQ3U0V2 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TraddQ3U0V2 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TraddQ3U0V2 4931409K22Rik-201ENSMUST00000088302 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TraddQ3U0V2 Sorcs1-206ENSMUST00000209783 3489 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TraddQ3U0V2 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TraddQ3U0V2 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TraddQ3U0V2 Abcd1-202ENSMUST00000114461 2323 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TraddQ3U0V2 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TraddQ3U0V2 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
TraddQ3U0V2 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TraddQ3U0V2 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TraddQ3U0V2 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TraddQ3U0V2 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TraddQ3U0V2 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TraddQ3U0V2 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TraddQ3U0V2 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
TraddQ3U0V2 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TraddQ3U0V2 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TraddQ3U0V2 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TraddQ3U0V2 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
TraddQ3U0V2 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TraddQ3U0V2 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms