Protein–RNA interactions for Protein: Q3TWW8

Srsf6, Serine/arginine-rich splicing factor 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 339 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srsf6Q3TWW8 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Srsf6Q3TWW8 Bloc1s2-ps-201ENSMUST00000183232 432 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Srsf6Q3TWW8 Hax1-206ENSMUST00000197786 857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Srsf6Q3TWW8 Gm19605-202ENSMUST00000221514 1084 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Srsf6Q3TWW8 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Srsf6Q3TWW8 Tmem50a-201ENSMUST00000030626 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Srsf6Q3TWW8 Olfr223-201ENSMUST00000061293 1111 ntAPPRIS P1 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Srsf6Q3TWW8 Olfr667-201ENSMUST00000071362 981 ntAPPRIS P1 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Srsf6Q3TWW8 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Srsf6Q3TWW8 Olfr666-201ENSMUST00000081116 957 ntAPPRIS P1 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Srsf6Q3TWW8 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Srsf6Q3TWW8 Gm44579-201ENSMUST00000142443 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Srsf6Q3TWW8 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Srsf6Q3TWW8 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Srsf6Q3TWW8 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Srsf6Q3TWW8 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Srsf6Q3TWW8 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Srsf6Q3TWW8 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Srsf6Q3TWW8 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Srsf6Q3TWW8 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Srsf6Q3TWW8 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Srsf6Q3TWW8 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Srsf6Q3TWW8 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Srsf6Q3TWW8 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Srsf6Q3TWW8 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Srsf6Q3TWW8 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Srsf6Q3TWW8 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Srsf6Q3TWW8 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Srsf6Q3TWW8 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Srsf6Q3TWW8 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Srsf6Q3TWW8 Thoc6-203ENSMUST00000115489 1083 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Srsf6Q3TWW8 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Srsf6Q3TWW8 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Srsf6Q3TWW8 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Srsf6Q3TWW8 Ak6-205ENSMUST00000190729 1184 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Srsf6Q3TWW8 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Srsf6Q3TWW8 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Srsf6Q3TWW8 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Srsf6Q3TWW8 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Srsf6Q3TWW8 Crip3-201ENSMUST00000024764 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Srsf6Q3TWW8 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Srsf6Q3TWW8 Acyp1-202ENSMUST00000065913 448 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Srsf6Q3TWW8 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Srsf6Q3TWW8 Mtus2-202ENSMUST00000085554 1009 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Srsf6Q3TWW8 Coq7-202ENSMUST00000098090 1215 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Srsf6Q3TWW8 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Srsf6Q3TWW8 Mmp21-202ENSMUST00000122136 1599 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Srsf6Q3TWW8 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Srsf6Q3TWW8 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Srsf6Q3TWW8 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Srsf6Q3TWW8 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Srsf6Q3TWW8 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Srsf6Q3TWW8 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Srsf6Q3TWW8 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Srsf6Q3TWW8 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Srsf6Q3TWW8 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Srsf6Q3TWW8 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Srsf6Q3TWW8 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Srsf6Q3TWW8 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Srsf6Q3TWW8 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Srsf6Q3TWW8 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Srsf6Q3TWW8 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Srsf6Q3TWW8 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Srsf6Q3TWW8 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Srsf6Q3TWW8 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Srsf6Q3TWW8 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Srsf6Q3TWW8 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Srsf6Q3TWW8 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Srsf6Q3TWW8 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Srsf6Q3TWW8 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Srsf6Q3TWW8 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Srsf6Q3TWW8 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Srsf6Q3TWW8 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Srsf6Q3TWW8 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Srsf6Q3TWW8 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Srsf6Q3TWW8 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Srsf6Q3TWW8 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Srsf6Q3TWW8 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Srsf6Q3TWW8 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Srsf6Q3TWW8 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Srsf6Q3TWW8 Oas1f-201ENSMUST00000057814 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Srsf6Q3TWW8 Gm24830-201ENSMUST00000102024 166 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Srsf6Q3TWW8 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Srsf6Q3TWW8 Gm16302-201ENSMUST00000159268 428 ntTSL 3 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Srsf6Q3TWW8 Ly6g6c-201ENSMUST00000173207 598 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Srsf6Q3TWW8 Ly6g6c-202ENSMUST00000173478 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Srsf6Q3TWW8 Gm25890-201ENSMUST00000177643 165 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Srsf6Q3TWW8 Rnu1b2-201ENSMUST00000178073 165 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Srsf6Q3TWW8 Rnu1b1-201ENSMUST00000178250 165 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Srsf6Q3TWW8 Gm22614-201ENSMUST00000178300 165 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Srsf6Q3TWW8 Gm2260-201ENSMUST00000184965 657 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Srsf6Q3TWW8 Gm42797-201ENSMUST00000197573 494 ntTSL 3 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Srsf6Q3TWW8 Gm44172-201ENSMUST00000203903 1235 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Srsf6Q3TWW8 Psma7-201ENSMUST00000029082 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Srsf6Q3TWW8 Gm22042-201ENSMUST00000082989 165 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Srsf6Q3TWW8 Gm26232-201ENSMUST00000083360 166 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Srsf6Q3TWW8 Gm24136-201ENSMUST00000083374 165 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Srsf6Q3TWW8 Rnu1b6-201ENSMUST00000083839 166 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Srsf6Q3TWW8 Gm26110-201ENSMUST00000083971 165 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Srsf6Q3TWW8 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.1 ms