Protein–RNA interactions for Protein: Q3TTP0

Shcbp1l, Testicular spindle-associated protein SHCBP1L, mousemouse

Predictions only

Length 639 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shcbp1lQ3TTP0 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Shcbp1lQ3TTP0 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Shcbp1lQ3TTP0 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Shcbp1lQ3TTP0 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Shcbp1lQ3TTP0 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Shcbp1lQ3TTP0 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Shcbp1lQ3TTP0 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Shcbp1lQ3TTP0 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Shcbp1lQ3TTP0 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Shcbp1lQ3TTP0 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Shcbp1lQ3TTP0 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Shcbp1lQ3TTP0 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Shcbp1lQ3TTP0 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Shcbp1lQ3TTP0 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Shcbp1lQ3TTP0 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Shcbp1lQ3TTP0 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Shcbp1lQ3TTP0 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Shcbp1lQ3TTP0 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Shcbp1lQ3TTP0 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Shcbp1lQ3TTP0 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Shcbp1lQ3TTP0 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Shcbp1lQ3TTP0 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Shcbp1lQ3TTP0 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Shcbp1lQ3TTP0 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Shcbp1lQ3TTP0 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Shcbp1lQ3TTP0 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Shcbp1lQ3TTP0 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Shcbp1lQ3TTP0 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Shcbp1lQ3TTP0 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Shcbp1lQ3TTP0 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Shcbp1lQ3TTP0 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Shcbp1lQ3TTP0 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Shcbp1lQ3TTP0 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Shcbp1lQ3TTP0 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Shcbp1lQ3TTP0 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Shcbp1lQ3TTP0 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Shcbp1lQ3TTP0 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Shcbp1lQ3TTP0 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Shcbp1lQ3TTP0 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Shcbp1lQ3TTP0 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Shcbp1lQ3TTP0 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Shcbp1lQ3TTP0 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Shcbp1lQ3TTP0 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Shcbp1lQ3TTP0 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Shcbp1lQ3TTP0 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Shcbp1lQ3TTP0 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Shcbp1lQ3TTP0 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Shcbp1lQ3TTP0 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Shcbp1lQ3TTP0 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Shcbp1lQ3TTP0 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Shcbp1lQ3TTP0 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Shcbp1lQ3TTP0 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Shcbp1lQ3TTP0 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Shcbp1lQ3TTP0 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Shcbp1lQ3TTP0 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Shcbp1lQ3TTP0 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Shcbp1lQ3TTP0 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Shcbp1lQ3TTP0 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Shcbp1lQ3TTP0 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Shcbp1lQ3TTP0 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Shcbp1lQ3TTP0 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Shcbp1lQ3TTP0 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Shcbp1lQ3TTP0 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Shcbp1lQ3TTP0 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Shcbp1lQ3TTP0 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Shcbp1lQ3TTP0 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Shcbp1lQ3TTP0 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Shcbp1lQ3TTP0 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Shcbp1lQ3TTP0 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Shcbp1lQ3TTP0 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Shcbp1lQ3TTP0 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Shcbp1lQ3TTP0 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Shcbp1lQ3TTP0 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Shcbp1lQ3TTP0 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Shcbp1lQ3TTP0 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Shcbp1lQ3TTP0 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Shcbp1lQ3TTP0 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Shcbp1lQ3TTP0 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Shcbp1lQ3TTP0 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Shcbp1lQ3TTP0 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Shcbp1lQ3TTP0 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Shcbp1lQ3TTP0 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Shcbp1lQ3TTP0 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Shcbp1lQ3TTP0 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Shcbp1lQ3TTP0 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Shcbp1lQ3TTP0 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Shcbp1lQ3TTP0 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Shcbp1lQ3TTP0 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Shcbp1lQ3TTP0 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Shcbp1lQ3TTP0 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Shcbp1lQ3TTP0 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Shcbp1lQ3TTP0 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Shcbp1lQ3TTP0 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Shcbp1lQ3TTP0 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Shcbp1lQ3TTP0 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Shcbp1lQ3TTP0 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Shcbp1lQ3TTP0 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Shcbp1lQ3TTP0 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Shcbp1lQ3TTP0 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Shcbp1lQ3TTP0 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms