Protein–RNA interactions for Protein: Q3TR08

Fndc4, Fibronectin type III domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 231 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc4Q3TR08 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Fndc4Q3TR08 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Fndc4Q3TR08 Gm24721-201ENSMUST00000103849 110 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Fndc4Q3TR08 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Fndc4Q3TR08 Gm26399-201ENSMUST00000103937 110 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Fndc4Q3TR08 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Fndc4Q3TR08 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Fndc4Q3TR08 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Fndc4Q3TR08 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Fndc4Q3TR08 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Fndc4Q3TR08 Gm25349-201ENSMUST00000177728 110 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Fndc4Q3TR08 Gm23616-201ENSMUST00000177797 110 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Fndc4Q3TR08 Gm25871-201ENSMUST00000177816 110 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Fndc4Q3TR08 Gm24752-201ENSMUST00000178240 110 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Fndc4Q3TR08 Gm24496-201ENSMUST00000178287 110 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Fndc4Q3TR08 Gm25649-201ENSMUST00000178476 110 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Fndc4Q3TR08 Gm25548-201ENSMUST00000178681 110 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Fndc4Q3TR08 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Fndc4Q3TR08 Gm23147-201ENSMUST00000178841 110 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Fndc4Q3TR08 Gm26095-201ENSMUST00000179270 110 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Fndc4Q3TR08 Gm22171-201ENSMUST00000179283 110 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Fndc4Q3TR08 Gm23936-201ENSMUST00000179354 110 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Fndc4Q3TR08 Gm22619-201ENSMUST00000179516 110 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Fndc4Q3TR08 Gm25255-201ENSMUST00000179579 110 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Fndc4Q3TR08 Gm24755-201ENSMUST00000179691 110 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Fndc4Q3TR08 Gm26506-201ENSMUST00000179692 110 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Fndc4Q3TR08 Gm25086-201ENSMUST00000179931 110 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Fndc4Q3TR08 Gm23243-201ENSMUST00000180047 110 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Fndc4Q3TR08 Gm24659-201ENSMUST00000180212 110 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Fndc4Q3TR08 Gm24169-201ENSMUST00000180244 110 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Fndc4Q3TR08 Gm23689-201ENSMUST00000180354 110 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Fndc4Q3TR08 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Fndc4Q3TR08 Gm27359-201ENSMUST00000184153 110 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Fndc4Q3TR08 Gm27785-201ENSMUST00000184268 110 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Fndc4Q3TR08 Gm27466-201ENSMUST00000184396 110 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Fndc4Q3TR08 Gm27703-201ENSMUST00000184836 110 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Fndc4Q3TR08 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Fndc4Q3TR08 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Fndc4Q3TR08 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Fndc4Q3TR08 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Fndc4Q3TR08 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Fndc4Q3TR08 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Fndc4Q3TR08 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Fndc4Q3TR08 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Fndc4Q3TR08 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Fndc4Q3TR08 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Fndc4Q3TR08 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Fndc4Q3TR08 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Fndc4Q3TR08 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Fndc4Q3TR08 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Fndc4Q3TR08 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Fndc4Q3TR08 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Fndc4Q3TR08 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Fndc4Q3TR08 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Fndc4Q3TR08 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Fndc4Q3TR08 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Fndc4Q3TR08 Spast-201ENSMUST00000024869 4672 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Fndc4Q3TR08 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Fndc4Q3TR08 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Fndc4Q3TR08 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Fndc4Q3TR08 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Fndc4Q3TR08 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Fndc4Q3TR08 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Fndc4Q3TR08 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Fndc4Q3TR08 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Fndc4Q3TR08 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Fndc4Q3TR08 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Fndc4Q3TR08 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Fndc4Q3TR08 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Fndc4Q3TR08 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Fndc4Q3TR08 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Fndc4Q3TR08 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Fndc4Q3TR08 Ip6k1-201ENSMUST00000035214 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Fndc4Q3TR08 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Fndc4Q3TR08 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Fndc4Q3TR08 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Fndc4Q3TR08 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Fndc4Q3TR08 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Fndc4Q3TR08 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Fndc4Q3TR08 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Fndc4Q3TR08 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Fndc4Q3TR08 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Fndc4Q3TR08 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Fndc4Q3TR08 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Fndc4Q3TR08 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Fndc4Q3TR08 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Fndc4Q3TR08 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Fndc4Q3TR08 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Fndc4Q3TR08 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Fndc4Q3TR08 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Fndc4Q3TR08 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Fndc4Q3TR08 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Fndc4Q3TR08 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Fndc4Q3TR08 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Fndc4Q3TR08 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Fndc4Q3TR08 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Fndc4Q3TR08 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Fndc4Q3TR08 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Fndc4Q3TR08 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Fndc4Q3TR08 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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