Protein–RNA interactions for Protein: Q3TP92

Ctdnep1, CTD nuclear envelope phosphatase 1, mousemouse

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Length 244 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdnep1Q3TP92 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ctdnep1Q3TP92 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ctdnep1Q3TP92 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ctdnep1Q3TP92 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ctdnep1Q3TP92 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ctdnep1Q3TP92 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ctdnep1Q3TP92 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ctdnep1Q3TP92 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ctdnep1Q3TP92 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ctdnep1Q3TP92 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ctdnep1Q3TP92 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ctdnep1Q3TP92 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ctdnep1Q3TP92 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Ctdnep1Q3TP92 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ctdnep1Q3TP92 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ctdnep1Q3TP92 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ctdnep1Q3TP92 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Ctdnep1Q3TP92 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ctdnep1Q3TP92 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Ctdnep1Q3TP92 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ctdnep1Q3TP92 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ctdnep1Q3TP92 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ctdnep1Q3TP92 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ctdnep1Q3TP92 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ctdnep1Q3TP92 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ctdnep1Q3TP92 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ctdnep1Q3TP92 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ctdnep1Q3TP92 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ctdnep1Q3TP92 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ctdnep1Q3TP92 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ctdnep1Q3TP92 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ctdnep1Q3TP92 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ctdnep1Q3TP92 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ctdnep1Q3TP92 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ctdnep1Q3TP92 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ctdnep1Q3TP92 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ctdnep1Q3TP92 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ctdnep1Q3TP92 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ctdnep1Q3TP92 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ctdnep1Q3TP92 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ctdnep1Q3TP92 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ctdnep1Q3TP92 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ctdnep1Q3TP92 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ctdnep1Q3TP92 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ctdnep1Q3TP92 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ctdnep1Q3TP92 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Ctdnep1Q3TP92 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ctdnep1Q3TP92 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ctdnep1Q3TP92 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Ctdnep1Q3TP92 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ctdnep1Q3TP92 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Ctdnep1Q3TP92 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ctdnep1Q3TP92 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Ctdnep1Q3TP92 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ctdnep1Q3TP92 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ctdnep1Q3TP92 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ctdnep1Q3TP92 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Ctdnep1Q3TP92 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ctdnep1Q3TP92 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ctdnep1Q3TP92 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ctdnep1Q3TP92 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ctdnep1Q3TP92 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ctdnep1Q3TP92 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ctdnep1Q3TP92 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ctdnep1Q3TP92 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ctdnep1Q3TP92 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ctdnep1Q3TP92 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ctdnep1Q3TP92 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Ctdnep1Q3TP92 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Ctdnep1Q3TP92 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ctdnep1Q3TP92 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ctdnep1Q3TP92 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ctdnep1Q3TP92 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ctdnep1Q3TP92 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ctdnep1Q3TP92 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ctdnep1Q3TP92 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Ctdnep1Q3TP92 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ctdnep1Q3TP92 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Ctdnep1Q3TP92 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Ctdnep1Q3TP92 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ctdnep1Q3TP92 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ctdnep1Q3TP92 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Ctdnep1Q3TP92 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ctdnep1Q3TP92 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ctdnep1Q3TP92 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Ctdnep1Q3TP92 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ctdnep1Q3TP92 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ctdnep1Q3TP92 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ctdnep1Q3TP92 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ctdnep1Q3TP92 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ctdnep1Q3TP92 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ctdnep1Q3TP92 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ctdnep1Q3TP92 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ctdnep1Q3TP92 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ctdnep1Q3TP92 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ctdnep1Q3TP92 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ctdnep1Q3TP92 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ctdnep1Q3TP92 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ctdnep1Q3TP92 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ctdnep1Q3TP92 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
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