Protein–RNA interactions for Protein: Q3TLI0

Trappc10, Trafficking protein particle complex subunit 10, mousemouse

Predictions only

Length 1,259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc10Q3TLI0 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trappc10Q3TLI0 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trappc10Q3TLI0 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trappc10Q3TLI0 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trappc10Q3TLI0 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trappc10Q3TLI0 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trappc10Q3TLI0 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trappc10Q3TLI0 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trappc10Q3TLI0 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trappc10Q3TLI0 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Trappc10Q3TLI0 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trappc10Q3TLI0 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trappc10Q3TLI0 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trappc10Q3TLI0 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trappc10Q3TLI0 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Trappc10Q3TLI0 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Trappc10Q3TLI0 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Trappc10Q3TLI0 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Trappc10Q3TLI0 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Trappc10Q3TLI0 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trappc10Q3TLI0 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trappc10Q3TLI0 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Trappc10Q3TLI0 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Trappc10Q3TLI0 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Trappc10Q3TLI0 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Trappc10Q3TLI0 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Trappc10Q3TLI0 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trappc10Q3TLI0 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trappc10Q3TLI0 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Trappc10Q3TLI0 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trappc10Q3TLI0 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trappc10Q3TLI0 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trappc10Q3TLI0 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trappc10Q3TLI0 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trappc10Q3TLI0 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trappc10Q3TLI0 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trappc10Q3TLI0 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trappc10Q3TLI0 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trappc10Q3TLI0 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Trappc10Q3TLI0 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trappc10Q3TLI0 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trappc10Q3TLI0 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trappc10Q3TLI0 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Trappc10Q3TLI0 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Trappc10Q3TLI0 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Trappc10Q3TLI0 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Trappc10Q3TLI0 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Trappc10Q3TLI0 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Trappc10Q3TLI0 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trappc10Q3TLI0 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trappc10Q3TLI0 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trappc10Q3TLI0 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trappc10Q3TLI0 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trappc10Q3TLI0 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trappc10Q3TLI0 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trappc10Q3TLI0 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Trappc10Q3TLI0 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trappc10Q3TLI0 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trappc10Q3TLI0 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trappc10Q3TLI0 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Trappc10Q3TLI0 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trappc10Q3TLI0 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trappc10Q3TLI0 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trappc10Q3TLI0 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Trappc10Q3TLI0 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trappc10Q3TLI0 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trappc10Q3TLI0 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Trappc10Q3TLI0 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trappc10Q3TLI0 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trappc10Q3TLI0 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trappc10Q3TLI0 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trappc10Q3TLI0 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trappc10Q3TLI0 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trappc10Q3TLI0 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trappc10Q3TLI0 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trappc10Q3TLI0 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trappc10Q3TLI0 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trappc10Q3TLI0 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trappc10Q3TLI0 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Trappc10Q3TLI0 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trappc10Q3TLI0 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trappc10Q3TLI0 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trappc10Q3TLI0 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trappc10Q3TLI0 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trappc10Q3TLI0 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trappc10Q3TLI0 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trappc10Q3TLI0 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trappc10Q3TLI0 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trappc10Q3TLI0 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trappc10Q3TLI0 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trappc10Q3TLI0 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trappc10Q3TLI0 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trappc10Q3TLI0 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trappc10Q3TLI0 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trappc10Q3TLI0 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trappc10Q3TLI0 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trappc10Q3TLI0 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trappc10Q3TLI0 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Trappc10Q3TLI0 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Trappc10Q3TLI0 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.9 ms