Protein–RNA interactions for Protein: Q3TIR1

Trappc13, Trafficking protein particle complex subunit 13, mousemouse

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Length 417 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc13Q3TIR1 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Trappc13Q3TIR1 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Trappc13Q3TIR1 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Trappc13Q3TIR1 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Trappc13Q3TIR1 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Trappc13Q3TIR1 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Trappc13Q3TIR1 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Trappc13Q3TIR1 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Trappc13Q3TIR1 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Trappc13Q3TIR1 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Trappc13Q3TIR1 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Trappc13Q3TIR1 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Trappc13Q3TIR1 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Trappc13Q3TIR1 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Trappc13Q3TIR1 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Trappc13Q3TIR1 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Trappc13Q3TIR1 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Trappc13Q3TIR1 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Trappc13Q3TIR1 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Trappc13Q3TIR1 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Trappc13Q3TIR1 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Trappc13Q3TIR1 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Trappc13Q3TIR1 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Trappc13Q3TIR1 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Trappc13Q3TIR1 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Trappc13Q3TIR1 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Trappc13Q3TIR1 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Trappc13Q3TIR1 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Trappc13Q3TIR1 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
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Trappc13Q3TIR1 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Trappc13Q3TIR1 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Trappc13Q3TIR1 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Trappc13Q3TIR1 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Trappc13Q3TIR1 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Trappc13Q3TIR1 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Trappc13Q3TIR1 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Trappc13Q3TIR1 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Trappc13Q3TIR1 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Trappc13Q3TIR1 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Trappc13Q3TIR1 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
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Trappc13Q3TIR1 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Trappc13Q3TIR1 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Trappc13Q3TIR1 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
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Trappc13Q3TIR1 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
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Trappc13Q3TIR1 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
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Trappc13Q3TIR1 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
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Trappc13Q3TIR1 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
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Trappc13Q3TIR1 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Trappc13Q3TIR1 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Trappc13Q3TIR1 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Trappc13Q3TIR1 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Trappc13Q3TIR1 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
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Trappc13Q3TIR1 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
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Trappc13Q3TIR1 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Trappc13Q3TIR1 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Trappc13Q3TIR1 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Trappc13Q3TIR1 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Trappc13Q3TIR1 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Trappc13Q3TIR1 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Trappc13Q3TIR1 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Trappc13Q3TIR1 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Trappc13Q3TIR1 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Trappc13Q3TIR1 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Trappc13Q3TIR1 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Trappc13Q3TIR1 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Trappc13Q3TIR1 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Trappc13Q3TIR1 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Trappc13Q3TIR1 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Trappc13Q3TIR1 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Trappc13Q3TIR1 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Trappc13Q3TIR1 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Trappc13Q3TIR1 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Trappc13Q3TIR1 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Trappc13Q3TIR1 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Trappc13Q3TIR1 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Trappc13Q3TIR1 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Trappc13Q3TIR1 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Trappc13Q3TIR1 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Trappc13Q3TIR1 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Trappc13Q3TIR1 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Trappc13Q3TIR1 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Trappc13Q3TIR1 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms