Protein–RNA interactions for Protein: Q2VPR5

Hdgfl1, Hepatoma-derived growth factor-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdgfl1Q2VPR5 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Hdgfl1Q2VPR5 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Hdgfl1Q2VPR5 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Hdgfl1Q2VPR5 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Hdgfl1Q2VPR5 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Hdgfl1Q2VPR5 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Hdgfl1Q2VPR5 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Hdgfl1Q2VPR5 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Hdgfl1Q2VPR5 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Hdgfl1Q2VPR5 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Hdgfl1Q2VPR5 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Hdgfl1Q2VPR5 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Hdgfl1Q2VPR5 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Hdgfl1Q2VPR5 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Hdgfl1Q2VPR5 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Hdgfl1Q2VPR5 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Hdgfl1Q2VPR5 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hdgfl1Q2VPR5 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hdgfl1Q2VPR5 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hdgfl1Q2VPR5 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hdgfl1Q2VPR5 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hdgfl1Q2VPR5 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hdgfl1Q2VPR5 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hdgfl1Q2VPR5 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hdgfl1Q2VPR5 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hdgfl1Q2VPR5 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hdgfl1Q2VPR5 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Hdgfl1Q2VPR5 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Hdgfl1Q2VPR5 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Hdgfl1Q2VPR5 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hdgfl1Q2VPR5 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hdgfl1Q2VPR5 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Hdgfl1Q2VPR5 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Hdgfl1Q2VPR5 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Hdgfl1Q2VPR5 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hdgfl1Q2VPR5 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hdgfl1Q2VPR5 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hdgfl1Q2VPR5 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hdgfl1Q2VPR5 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hdgfl1Q2VPR5 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hdgfl1Q2VPR5 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hdgfl1Q2VPR5 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hdgfl1Q2VPR5 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hdgfl1Q2VPR5 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hdgfl1Q2VPR5 Plxnb2-201ENSMUST00000060808 6394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hdgfl1Q2VPR5 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hdgfl1Q2VPR5 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hdgfl1Q2VPR5 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hdgfl1Q2VPR5 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hdgfl1Q2VPR5 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hdgfl1Q2VPR5 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hdgfl1Q2VPR5 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Hdgfl1Q2VPR5 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Hdgfl1Q2VPR5 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hdgfl1Q2VPR5 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hdgfl1Q2VPR5 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hdgfl1Q2VPR5 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hdgfl1Q2VPR5 Mast3-203ENSMUST00000211948 4251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Hdgfl1Q2VPR5 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Hdgfl1Q2VPR5 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hdgfl1Q2VPR5 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hdgfl1Q2VPR5 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Hdgfl1Q2VPR5 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hdgfl1Q2VPR5 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hdgfl1Q2VPR5 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hdgfl1Q2VPR5 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hdgfl1Q2VPR5 Mylk-201ENSMUST00000023538 7824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hdgfl1Q2VPR5 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hdgfl1Q2VPR5 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hdgfl1Q2VPR5 Atp2b2-203ENSMUST00000101045 8877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hdgfl1Q2VPR5 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hdgfl1Q2VPR5 Wdr26-208ENSMUST00000162963 6452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hdgfl1Q2VPR5 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hdgfl1Q2VPR5 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hdgfl1Q2VPR5 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hdgfl1Q2VPR5 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hdgfl1Q2VPR5 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hdgfl1Q2VPR5 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hdgfl1Q2VPR5 AC154532.1-201ENSMUST00000227860 965 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Hdgfl1Q2VPR5 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hdgfl1Q2VPR5 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hdgfl1Q2VPR5 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hdgfl1Q2VPR5 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hdgfl1Q2VPR5 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hdgfl1Q2VPR5 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hdgfl1Q2VPR5 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hdgfl1Q2VPR5 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms