Protein–RNA interactions for Protein: Q1W617

Shroom4, Protein Shroom4, mousemouse

Predictions only

Length 1,475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shroom4Q1W617 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Shroom4Q1W617 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Shroom4Q1W617 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Shroom4Q1W617 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Shroom4Q1W617 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Shroom4Q1W617 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Shroom4Q1W617 AC123857.2-201ENSMUST00000225756 1582 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Shroom4Q1W617 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Shroom4Q1W617 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Shroom4Q1W617 Gm12502-201ENSMUST00000120197 444 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Shroom4Q1W617 Rhoc-204ENSMUST00000176347 583 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Shroom4Q1W617 Gm26973-201ENSMUST00000182105 696 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Shroom4Q1W617 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Shroom4Q1W617 Cdc34-208ENSMUST00000219791 799 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Shroom4Q1W617 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Shroom4Q1W617 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Shroom4Q1W617 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Shroom4Q1W617 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Shroom4Q1W617 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Shroom4Q1W617 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Shroom4Q1W617 Gm43289-201ENSMUST00000200537 1475 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Shroom4Q1W617 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Shroom4Q1W617 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Shroom4Q1W617 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Shroom4Q1W617 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Shroom4Q1W617 Tmem19-206ENSMUST00000218731 1346 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Shroom4Q1W617 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Shroom4Q1W617 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Shroom4Q1W617 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Shroom4Q1W617 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Shroom4Q1W617 6030468B19Rik-201ENSMUST00000106331 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Shroom4Q1W617 Gm14028-201ENSMUST00000117434 479 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Shroom4Q1W617 Rbm3-ps-201ENSMUST00000121422 465 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Shroom4Q1W617 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Shroom4Q1W617 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Shroom4Q1W617 Gm38092-201ENSMUST00000195600 653 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Shroom4Q1W617 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Shroom4Q1W617 Nsd1-205ENSMUST00000224693 852 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Shroom4Q1W617 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Shroom4Q1W617 Gm10782-202ENSMUST00000223775 1480 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Shroom4Q1W617 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Shroom4Q1W617 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Shroom4Q1W617 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Shroom4Q1W617 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Shroom4Q1W617 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Shroom4Q1W617 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Shroom4Q1W617 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Shroom4Q1W617 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Shroom4Q1W617 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Shroom4Q1W617 Igf1-204ENSMUST00000121161 1344 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Shroom4Q1W617 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Shroom4Q1W617 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Shroom4Q1W617 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Shroom4Q1W617 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Shroom4Q1W617 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Shroom4Q1W617 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Shroom4Q1W617 Fam71e1-201ENSMUST00000107927 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Shroom4Q1W617 Gm14208-201ENSMUST00000119645 678 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Shroom4Q1W617 Tex22-201ENSMUST00000012355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Shroom4Q1W617 Gm15276-201ENSMUST00000145953 498 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Shroom4Q1W617 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Shroom4Q1W617 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Shroom4Q1W617 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Shroom4Q1W617 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Shroom4Q1W617 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Shroom4Q1W617 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Shroom4Q1W617 Pga5-201ENSMUST00000025647 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Shroom4Q1W617 Fut8-201ENSMUST00000062804 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Shroom4Q1W617 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Shroom4Q1W617 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Shroom4Q1W617 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Shroom4Q1W617 Rpl15-203ENSMUST00000100799 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Shroom4Q1W617 Gm25043-201ENSMUST00000158604 212 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Shroom4Q1W617 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Shroom4Q1W617 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Shroom4Q1W617 Cym-201ENSMUST00000029504 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Shroom4Q1W617 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Shroom4Q1W617 Nmbr-201ENSMUST00000020015 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Shroom4Q1W617 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Shroom4Q1W617 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Shroom4Q1W617 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Shroom4Q1W617 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Shroom4Q1W617 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Shroom4Q1W617 Efemp2-209ENSMUST00000167371 1382 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Shroom4Q1W617 Gm37827-201ENSMUST00000194486 1542 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Shroom4Q1W617 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Shroom4Q1W617 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Shroom4Q1W617 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Shroom4Q1W617 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Shroom4Q1W617 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Shroom4Q1W617 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Shroom4Q1W617 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Shroom4Q1W617 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Shroom4Q1W617 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Shroom4Q1W617 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Shroom4Q1W617 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Shroom4Q1W617 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Shroom4Q1W617 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Shroom4Q1W617 Gm14130-201ENSMUST00000118417 987 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Shroom4Q1W617 Spata3-211ENSMUST00000159876 760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.9 ms