Protein–RNA interactions for Protein: Q1RLL3

Cpne9, Copine-9, mousemouse

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Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne9Q1RLL3 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cpne9Q1RLL3 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cpne9Q1RLL3 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cpne9Q1RLL3 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cpne9Q1RLL3 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Cpne9Q1RLL3 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Cpne9Q1RLL3 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Cpne9Q1RLL3 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Cpne9Q1RLL3 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cpne9Q1RLL3 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Cpne9Q1RLL3 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cpne9Q1RLL3 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cpne9Q1RLL3 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cpne9Q1RLL3 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cpne9Q1RLL3 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cpne9Q1RLL3 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cpne9Q1RLL3 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cpne9Q1RLL3 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cpne9Q1RLL3 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cpne9Q1RLL3 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cpne9Q1RLL3 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cpne9Q1RLL3 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cpne9Q1RLL3 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cpne9Q1RLL3 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cpne9Q1RLL3 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cpne9Q1RLL3 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cpne9Q1RLL3 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cpne9Q1RLL3 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cpne9Q1RLL3 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cpne9Q1RLL3 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cpne9Q1RLL3 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cpne9Q1RLL3 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cpne9Q1RLL3 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cpne9Q1RLL3 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cpne9Q1RLL3 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cpne9Q1RLL3 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cpne9Q1RLL3 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cpne9Q1RLL3 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cpne9Q1RLL3 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cpne9Q1RLL3 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cpne9Q1RLL3 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cpne9Q1RLL3 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cpne9Q1RLL3 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Cpne9Q1RLL3 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cpne9Q1RLL3 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cpne9Q1RLL3 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cpne9Q1RLL3 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cpne9Q1RLL3 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Cpne9Q1RLL3 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cpne9Q1RLL3 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cpne9Q1RLL3 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cpne9Q1RLL3 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Cpne9Q1RLL3 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cpne9Q1RLL3 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cpne9Q1RLL3 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cpne9Q1RLL3 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cpne9Q1RLL3 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cpne9Q1RLL3 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Cpne9Q1RLL3 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Cpne9Q1RLL3 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Cpne9Q1RLL3 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Cpne9Q1RLL3 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Cpne9Q1RLL3 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Cpne9Q1RLL3 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Cpne9Q1RLL3 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cpne9Q1RLL3 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cpne9Q1RLL3 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cpne9Q1RLL3 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cpne9Q1RLL3 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cpne9Q1RLL3 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cpne9Q1RLL3 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cpne9Q1RLL3 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cpne9Q1RLL3 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cpne9Q1RLL3 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cpne9Q1RLL3 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cpne9Q1RLL3 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cpne9Q1RLL3 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cpne9Q1RLL3 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cpne9Q1RLL3 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cpne9Q1RLL3 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cpne9Q1RLL3 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cpne9Q1RLL3 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Cpne9Q1RLL3 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Cpne9Q1RLL3 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cpne9Q1RLL3 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Cpne9Q1RLL3 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cpne9Q1RLL3 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cpne9Q1RLL3 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cpne9Q1RLL3 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cpne9Q1RLL3 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Cpne9Q1RLL3 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cpne9Q1RLL3 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cpne9Q1RLL3 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cpne9Q1RLL3 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cpne9Q1RLL3 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cpne9Q1RLL3 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cpne9Q1RLL3 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cpne9Q1RLL3 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cpne9Q1RLL3 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cpne9Q1RLL3 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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