Protein–RNA interactions for Protein: Q0VG85

Ccdc162p, Coiled-coil domain-containing protein 162, mousemouse

Predictions only

Length 912 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc162pQ0VG85 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc162pQ0VG85 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc162pQ0VG85 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc162pQ0VG85 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc162pQ0VG85 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc162pQ0VG85 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc162pQ0VG85 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc162pQ0VG85 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc162pQ0VG85 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc162pQ0VG85 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc162pQ0VG85 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc162pQ0VG85 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc162pQ0VG85 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc162pQ0VG85 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc162pQ0VG85 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc162pQ0VG85 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc162pQ0VG85 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc162pQ0VG85 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc162pQ0VG85 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc162pQ0VG85 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc162pQ0VG85 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc162pQ0VG85 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc162pQ0VG85 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc162pQ0VG85 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc162pQ0VG85 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc162pQ0VG85 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc162pQ0VG85 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc162pQ0VG85 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc162pQ0VG85 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc162pQ0VG85 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc162pQ0VG85 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc162pQ0VG85 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc162pQ0VG85 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc162pQ0VG85 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc162pQ0VG85 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc162pQ0VG85 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc162pQ0VG85 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc162pQ0VG85 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc162pQ0VG85 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc162pQ0VG85 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc162pQ0VG85 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc162pQ0VG85 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc162pQ0VG85 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc162pQ0VG85 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc162pQ0VG85 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc162pQ0VG85 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc162pQ0VG85 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc162pQ0VG85 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc162pQ0VG85 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc162pQ0VG85 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc162pQ0VG85 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ccdc162pQ0VG85 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ccdc162pQ0VG85 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ccdc162pQ0VG85 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ccdc162pQ0VG85 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ccdc162pQ0VG85 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ccdc162pQ0VG85 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ccdc162pQ0VG85 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc162pQ0VG85 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc162pQ0VG85 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc162pQ0VG85 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc162pQ0VG85 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc162pQ0VG85 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc162pQ0VG85 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc162pQ0VG85 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc162pQ0VG85 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc162pQ0VG85 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc162pQ0VG85 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc162pQ0VG85 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc162pQ0VG85 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc162pQ0VG85 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc162pQ0VG85 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc162pQ0VG85 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc162pQ0VG85 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc162pQ0VG85 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc162pQ0VG85 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc162pQ0VG85 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc162pQ0VG85 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc162pQ0VG85 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc162pQ0VG85 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc162pQ0VG85 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc162pQ0VG85 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc162pQ0VG85 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc162pQ0VG85 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc162pQ0VG85 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc162pQ0VG85 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc162pQ0VG85 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc162pQ0VG85 Gm45743-201ENSMUST00000212701 2795 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc162pQ0VG85 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc162pQ0VG85 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc162pQ0VG85 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc162pQ0VG85 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc162pQ0VG85 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc162pQ0VG85 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc162pQ0VG85 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc162pQ0VG85 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc162pQ0VG85 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc162pQ0VG85 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc162pQ0VG85 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc162pQ0VG85 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.6 ms