Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF55

Atp2b3, Calcium-transporting ATPase, mousemouse

Predictions only

Length 1,220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp2b3Q0VF55 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atp2b3Q0VF55 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atp2b3Q0VF55 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atp2b3Q0VF55 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atp2b3Q0VF55 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Atp2b3Q0VF55 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atp2b3Q0VF55 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Atp2b3Q0VF55 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atp2b3Q0VF55 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atp2b3Q0VF55 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Atp2b3Q0VF55 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atp2b3Q0VF55 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atp2b3Q0VF55 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atp2b3Q0VF55 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atp2b3Q0VF55 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atp2b3Q0VF55 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atp2b3Q0VF55 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atp2b3Q0VF55 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Atp2b3Q0VF55 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atp2b3Q0VF55 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atp2b3Q0VF55 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atp2b3Q0VF55 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atp2b3Q0VF55 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atp2b3Q0VF55 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atp2b3Q0VF55 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atp2b3Q0VF55 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atp2b3Q0VF55 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atp2b3Q0VF55 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atp2b3Q0VF55 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atp2b3Q0VF55 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Atp2b3Q0VF55 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atp2b3Q0VF55 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atp2b3Q0VF55 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atp2b3Q0VF55 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Atp2b3Q0VF55 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atp2b3Q0VF55 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atp2b3Q0VF55 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atp2b3Q0VF55 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Atp2b3Q0VF55 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atp2b3Q0VF55 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atp2b3Q0VF55 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atp2b3Q0VF55 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atp2b3Q0VF55 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atp2b3Q0VF55 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atp2b3Q0VF55 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atp2b3Q0VF55 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atp2b3Q0VF55 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atp2b3Q0VF55 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atp2b3Q0VF55 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atp2b3Q0VF55 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atp2b3Q0VF55 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atp2b3Q0VF55 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atp2b3Q0VF55 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atp2b3Q0VF55 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atp2b3Q0VF55 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atp2b3Q0VF55 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atp2b3Q0VF55 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atp2b3Q0VF55 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atp2b3Q0VF55 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atp2b3Q0VF55 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atp2b3Q0VF55 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atp2b3Q0VF55 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atp2b3Q0VF55 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atp2b3Q0VF55 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atp2b3Q0VF55 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atp2b3Q0VF55 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atp2b3Q0VF55 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atp2b3Q0VF55 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atp2b3Q0VF55 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atp2b3Q0VF55 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atp2b3Q0VF55 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atp2b3Q0VF55 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atp2b3Q0VF55 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Atp2b3Q0VF55 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Atp2b3Q0VF55 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Atp2b3Q0VF55 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atp2b3Q0VF55 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Atp2b3Q0VF55 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atp2b3Q0VF55 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atp2b3Q0VF55 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atp2b3Q0VF55 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atp2b3Q0VF55 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atp2b3Q0VF55 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atp2b3Q0VF55 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atp2b3Q0VF55 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atp2b3Q0VF55 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Atp2b3Q0VF55 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atp2b3Q0VF55 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atp2b3Q0VF55 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Atp2b3Q0VF55 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Atp2b3Q0VF55 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Atp2b3Q0VF55 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Atp2b3Q0VF55 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Atp2b3Q0VF55 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Atp2b3Q0VF55 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Atp2b3Q0VF55 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Atp2b3Q0VF55 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Atp2b3Q0VF55 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Atp2b3Q0VF55 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Atp2b3Q0VF55 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.9 ms