Protein–RNA interactions for Protein: Q0VDN7

Rundc1, RUN domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rundc1Q0VDN7 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rundc1Q0VDN7 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rundc1Q0VDN7 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rundc1Q0VDN7 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rundc1Q0VDN7 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Rundc1Q0VDN7 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Rundc1Q0VDN7 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Rundc1Q0VDN7 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC18.83■□□□□ 0.61
Rundc1Q0VDN7 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Rundc1Q0VDN7 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Rundc1Q0VDN7 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Rundc1Q0VDN7 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Rundc1Q0VDN7 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Rundc1Q0VDN7 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Rundc1Q0VDN7 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Rundc1Q0VDN7 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Rundc1Q0VDN7 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Rundc1Q0VDN7 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Rundc1Q0VDN7 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Rundc1Q0VDN7 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Rundc1Q0VDN7 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Rundc1Q0VDN7 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Rundc1Q0VDN7 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Rundc1Q0VDN7 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Rundc1Q0VDN7 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Rundc1Q0VDN7 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Rundc1Q0VDN7 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Rundc1Q0VDN7 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Rundc1Q0VDN7 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Rundc1Q0VDN7 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Rundc1Q0VDN7 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Rundc1Q0VDN7 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Rundc1Q0VDN7 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Rundc1Q0VDN7 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Rundc1Q0VDN7 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Rundc1Q0VDN7 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Rundc1Q0VDN7 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Rundc1Q0VDN7 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Rundc1Q0VDN7 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Rundc1Q0VDN7 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Rundc1Q0VDN7 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Rundc1Q0VDN7 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Rundc1Q0VDN7 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Rundc1Q0VDN7 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Rundc1Q0VDN7 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Rundc1Q0VDN7 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Rundc1Q0VDN7 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Rundc1Q0VDN7 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Rundc1Q0VDN7 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Rundc1Q0VDN7 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Rundc1Q0VDN7 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Rundc1Q0VDN7 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Rundc1Q0VDN7 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Rundc1Q0VDN7 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Rundc1Q0VDN7 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Rundc1Q0VDN7 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Rundc1Q0VDN7 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Rundc1Q0VDN7 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Rundc1Q0VDN7 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rundc1Q0VDN7 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rundc1Q0VDN7 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rundc1Q0VDN7 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rundc1Q0VDN7 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Rundc1Q0VDN7 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rundc1Q0VDN7 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rundc1Q0VDN7 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rundc1Q0VDN7 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Rundc1Q0VDN7 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rundc1Q0VDN7 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Rundc1Q0VDN7 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rundc1Q0VDN7 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Rundc1Q0VDN7 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rundc1Q0VDN7 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rundc1Q0VDN7 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rundc1Q0VDN7 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rundc1Q0VDN7 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rundc1Q0VDN7 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rundc1Q0VDN7 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rundc1Q0VDN7 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rundc1Q0VDN7 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rundc1Q0VDN7 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rundc1Q0VDN7 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rundc1Q0VDN7 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Rundc1Q0VDN7 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Rundc1Q0VDN7 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rundc1Q0VDN7 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rundc1Q0VDN7 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Rundc1Q0VDN7 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Rundc1Q0VDN7 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Rundc1Q0VDN7 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Rundc1Q0VDN7 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Rundc1Q0VDN7 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Rundc1Q0VDN7 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Rundc1Q0VDN7 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Rundc1Q0VDN7 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Rundc1Q0VDN7 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Rundc1Q0VDN7 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Rundc1Q0VDN7 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Rundc1Q0VDN7 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Rundc1Q0VDN7 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms