Protein–RNA interactions for Protein: Q0P5X1

Lrriq1, Leucine-rich repeat and IQ domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,673 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrriq1Q0P5X1 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Lrriq1Q0P5X1 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Lrriq1Q0P5X1 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Lrriq1Q0P5X1 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Lrriq1Q0P5X1 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Lrriq1Q0P5X1 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Lrriq1Q0P5X1 Pisd-ps2-201ENSMUST00000127960 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Lrriq1Q0P5X1 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Lrriq1Q0P5X1 Pstpip2-201ENSMUST00000114741 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Lrriq1Q0P5X1 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Lrriq1Q0P5X1 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Lrriq1Q0P5X1 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Lrriq1Q0P5X1 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Lrriq1Q0P5X1 Prdx5-203ENSMUST00000149261 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Lrriq1Q0P5X1 1700099I09Rik-201ENSMUST00000167834 769 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Lrriq1Q0P5X1 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Lrriq1Q0P5X1 Gm10774-201ENSMUST00000188689 204 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Lrriq1Q0P5X1 Gm43962-201ENSMUST00000203898 190 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Lrriq1Q0P5X1 AC125209.1-201ENSMUST00000225812 766 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Lrriq1Q0P5X1 Ngdn-201ENSMUST00000022815 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Lrriq1Q0P5X1 Olfr117-201ENSMUST00000073636 954 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Lrriq1Q0P5X1 Hopx-201ENSMUST00000081964 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Lrriq1Q0P5X1 Mir483-201ENSMUST00000093631 73 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Lrriq1Q0P5X1 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Lrriq1Q0P5X1 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Lrriq1Q0P5X1 Tmem176b-202ENSMUST00000164733 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Lrriq1Q0P5X1 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Lrriq1Q0P5X1 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Lrriq1Q0P5X1 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Lrriq1Q0P5X1 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Lrriq1Q0P5X1 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Lrriq1Q0P5X1 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Lrriq1Q0P5X1 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Lrriq1Q0P5X1 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Lrriq1Q0P5X1 Phyhd1-202ENSMUST00000091132 1353 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Lrriq1Q0P5X1 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Lrriq1Q0P5X1 Vps25-205ENSMUST00000121331 790 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Lrriq1Q0P5X1 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Lrriq1Q0P5X1 1700088E04Rik-201ENSMUST00000169604 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Lrriq1Q0P5X1 1700088E04Rik-203ENSMUST00000186053 535 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Lrriq1Q0P5X1 4933408A14Rik-201ENSMUST00000199037 729 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Lrriq1Q0P5X1 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Lrriq1Q0P5X1 Gm3318-201ENSMUST00000217604 1183 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Lrriq1Q0P5X1 Rab13-201ENSMUST00000065418 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Lrriq1Q0P5X1 1110025L11Rik-201ENSMUST00000089104 591 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Lrriq1Q0P5X1 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Lrriq1Q0P5X1 Spata7-203ENSMUST00000101146 1913 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Lrriq1Q0P5X1 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Lrriq1Q0P5X1 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Lrriq1Q0P5X1 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Lrriq1Q0P5X1 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Lrriq1Q0P5X1 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Lrriq1Q0P5X1 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Lrriq1Q0P5X1 Olfr139-204ENSMUST00000214111 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Lrriq1Q0P5X1 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Lrriq1Q0P5X1 Gm11451-201ENSMUST00000118946 630 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Lrriq1Q0P5X1 Gm14999-201ENSMUST00000121039 624 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Lrriq1Q0P5X1 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Lrriq1Q0P5X1 Lypd1-203ENSMUST00000159529 989 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Lrriq1Q0P5X1 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Lrriq1Q0P5X1 Gm28071-201ENSMUST00000190355 478 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Lrriq1Q0P5X1 S100a3-205ENSMUST00000200508 587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Lrriq1Q0P5X1 Gm4482-201ENSMUST00000200876 742 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Lrriq1Q0P5X1 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Lrriq1Q0P5X1 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Lrriq1Q0P5X1 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Lrriq1Q0P5X1 Zfp809-201ENSMUST00000072465 1425 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Lrriq1Q0P5X1 Ecsit-204ENSMUST00000180180 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Lrriq1Q0P5X1 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Lrriq1Q0P5X1 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Lrriq1Q0P5X1 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Lrriq1Q0P5X1 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Lrriq1Q0P5X1 4631405J19Rik-204ENSMUST00000145926 936 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Lrriq1Q0P5X1 AA545190-201ENSMUST00000203495 1053 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Lrriq1Q0P5X1 Mt1-202ENSMUST00000211807 1085 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Lrriq1Q0P5X1 Sdf2-201ENSMUST00000002133 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Lrriq1Q0P5X1 Gm6722-201ENSMUST00000221586 390 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Lrriq1Q0P5X1 Hist1h3a-201ENSMUST00000091701 534 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Lrriq1Q0P5X1 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Lrriq1Q0P5X1 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Lrriq1Q0P5X1 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Lrriq1Q0P5X1 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Lrriq1Q0P5X1 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Lrriq1Q0P5X1 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Lrriq1Q0P5X1 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Lrriq1Q0P5X1 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Lrriq1Q0P5X1 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Lrriq1Q0P5X1 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Lrriq1Q0P5X1 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Lrriq1Q0P5X1 Gm13668-201ENSMUST00000119237 1001 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Lrriq1Q0P5X1 Gm12130-201ENSMUST00000133599 639 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Lrriq1Q0P5X1 D630008O14Rik-202ENSMUST00000149909 1043 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Lrriq1Q0P5X1 1700029J03Rik-201ENSMUST00000185803 789 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Lrriq1Q0P5X1 Gm43692-201ENSMUST00000198236 1062 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Lrriq1Q0P5X1 4930430O22Rik-202ENSMUST00000202548 579 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
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Lrriq1Q0P5X1 Calca-201ENSMUST00000032906 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Lrriq1Q0P5X1 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Lrriq1Q0P5X1 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Lrriq1Q0P5X1 AC158355.1-201ENSMUST00000215895 1705 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54 ms