Protein–RNA interactions for Protein: Q0MW30

Neurl1b, E3 ubiquitin-protein ligase NEURL1B, mousemouse

Predictions only

Length 546 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Neurl1bQ0MW30 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Neurl1bQ0MW30 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Neurl1bQ0MW30 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Neurl1bQ0MW30 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Neurl1bQ0MW30 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Neurl1bQ0MW30 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Neurl1bQ0MW30 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Neurl1bQ0MW30 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Neurl1bQ0MW30 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Neurl1bQ0MW30 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Neurl1bQ0MW30 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Neurl1bQ0MW30 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Neurl1bQ0MW30 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Neurl1bQ0MW30 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Neurl1bQ0MW30 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Neurl1bQ0MW30 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Neurl1bQ0MW30 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.07■□□□□ 0
Neurl1bQ0MW30 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Neurl1bQ0MW30 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Neurl1bQ0MW30 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Neurl1bQ0MW30 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Neurl1bQ0MW30 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Neurl1bQ0MW30 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Neurl1bQ0MW30 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Neurl1bQ0MW30 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Neurl1bQ0MW30 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Neurl1bQ0MW30 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Neurl1bQ0MW30 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Neurl1bQ0MW30 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Neurl1bQ0MW30 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Neurl1bQ0MW30 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Neurl1bQ0MW30 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Neurl1bQ0MW30 Gm5940-201ENSMUST00000117582 1068 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Neurl1bQ0MW30 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Neurl1bQ0MW30 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Neurl1bQ0MW30 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Neurl1bQ0MW30 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Neurl1bQ0MW30 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Neurl1bQ0MW30 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Neurl1bQ0MW30 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Neurl1bQ0MW30 Gm38319-201ENSMUST00000194537 1266 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Neurl1bQ0MW30 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Neurl1bQ0MW30 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Neurl1bQ0MW30 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Neurl1bQ0MW30 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Neurl1bQ0MW30 Gm45880-201ENSMUST00000213041 853 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Neurl1bQ0MW30 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Neurl1bQ0MW30 Gm7399-201ENSMUST00000032395 858 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Neurl1bQ0MW30 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Neurl1bQ0MW30 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Neurl1bQ0MW30 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Neurl1bQ0MW30 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Neurl1bQ0MW30 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Neurl1bQ0MW30 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Neurl1bQ0MW30 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Neurl1bQ0MW30 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Neurl1bQ0MW30 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Neurl1bQ0MW30 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Neurl1bQ0MW30 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Neurl1bQ0MW30 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Neurl1bQ0MW30 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Neurl1bQ0MW30 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC15.06■□□□□ 0
Neurl1bQ0MW30 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Neurl1bQ0MW30 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Neurl1bQ0MW30 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Neurl1bQ0MW30 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Neurl1bQ0MW30 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Neurl1bQ0MW30 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Neurl1bQ0MW30 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Neurl1bQ0MW30 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Neurl1bQ0MW30 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Neurl1bQ0MW30 1600014C10Rik-203ENSMUST00000177983 403 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Neurl1bQ0MW30 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Neurl1bQ0MW30 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Neurl1bQ0MW30 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Neurl1bQ0MW30 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Neurl1bQ0MW30 Gm9823-201ENSMUST00000051212 327 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Neurl1bQ0MW30 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Neurl1bQ0MW30 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Neurl1bQ0MW30 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.06■□□□□ 0
Neurl1bQ0MW30 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Neurl1bQ0MW30 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Neurl1bQ0MW30 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Neurl1bQ0MW30 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Neurl1bQ0MW30 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Neurl1bQ0MW30 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Neurl1bQ0MW30 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Neurl1bQ0MW30 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Neurl1bQ0MW30 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Neurl1bQ0MW30 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Neurl1bQ0MW30 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Neurl1bQ0MW30 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Neurl1bQ0MW30 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Neurl1bQ0MW30 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Neurl1bQ0MW30 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Neurl1bQ0MW30 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Neurl1bQ0MW30 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Neurl1bQ0MW30 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Neurl1bQ0MW30 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Neurl1bQ0MW30 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.4 ms