Protein–RNA interactions for Protein: Q06649

Sh3bp2, SH3 domain-binding protein 2, mousemouse

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp2Q06649 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Sh3bp2Q06649 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Sh3bp2Q06649 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Sh3bp2Q06649 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Sh3bp2Q06649 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Sh3bp2Q06649 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Sh3bp2Q06649 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Sh3bp2Q06649 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Sh3bp2Q06649 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Sh3bp2Q06649 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Sh3bp2Q06649 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Sh3bp2Q06649 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Sh3bp2Q06649 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Sh3bp2Q06649 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Sh3bp2Q06649 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Sh3bp2Q06649 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Sh3bp2Q06649 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Sh3bp2Q06649 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Sh3bp2Q06649 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Sh3bp2Q06649 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Sh3bp2Q06649 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Sh3bp2Q06649 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Sh3bp2Q06649 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Sh3bp2Q06649 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Sh3bp2Q06649 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Sh3bp2Q06649 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Sh3bp2Q06649 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Sh3bp2Q06649 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Sh3bp2Q06649 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Sh3bp2Q06649 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Sh3bp2Q06649 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Sh3bp2Q06649 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Sh3bp2Q06649 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Sh3bp2Q06649 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Sh3bp2Q06649 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Sh3bp2Q06649 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Sh3bp2Q06649 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Sh3bp2Q06649 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Sh3bp2Q06649 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Sh3bp2Q06649 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Sh3bp2Q06649 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Sh3bp2Q06649 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Sh3bp2Q06649 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Sh3bp2Q06649 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Sh3bp2Q06649 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Sh3bp2Q06649 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Sh3bp2Q06649 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Sh3bp2Q06649 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Sh3bp2Q06649 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
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Sh3bp2Q06649 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
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Sh3bp2Q06649 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
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Sh3bp2Q06649 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Sh3bp2Q06649 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
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Sh3bp2Q06649 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Sh3bp2Q06649 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Sh3bp2Q06649 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Sh3bp2Q06649 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Sh3bp2Q06649 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Sh3bp2Q06649 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Sh3bp2Q06649 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Sh3bp2Q06649 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Sh3bp2Q06649 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Sh3bp2Q06649 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Sh3bp2Q06649 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Sh3bp2Q06649 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Sh3bp2Q06649 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Sh3bp2Q06649 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Sh3bp2Q06649 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Sh3bp2Q06649 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Sh3bp2Q06649 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Sh3bp2Q06649 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Sh3bp2Q06649 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Sh3bp2Q06649 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Sh3bp2Q06649 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Sh3bp2Q06649 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Sh3bp2Q06649 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Sh3bp2Q06649 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Sh3bp2Q06649 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Sh3bp2Q06649 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Sh3bp2Q06649 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Sh3bp2Q06649 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Sh3bp2Q06649 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Sh3bp2Q06649 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Sh3bp2Q06649 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
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