Protein–RNA interactions for Protein: Q06348

Prrx2, Paired mesoderm homeobox protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrx2Q06348 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Prrx2Q06348 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Prrx2Q06348 Cma2-201ENSMUST00000089555 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Prrx2Q06348 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Prrx2Q06348 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Prrx2Q06348 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Prrx2Q06348 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Prrx2Q06348 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Prrx2Q06348 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Prrx2Q06348 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Prrx2Q06348 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Prrx2Q06348 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Prrx2Q06348 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Prrx2Q06348 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Prrx2Q06348 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Prrx2Q06348 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Prrx2Q06348 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Prrx2Q06348 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Prrx2Q06348 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Prrx2Q06348 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Prrx2Q06348 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Prrx2Q06348 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Prrx2Q06348 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Prrx2Q06348 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Prrx2Q06348 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Prrx2Q06348 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Prrx2Q06348 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Prrx2Q06348 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Prrx2Q06348 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Prrx2Q06348 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Prrx2Q06348 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Prrx2Q06348 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Prrx2Q06348 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Prrx2Q06348 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Prrx2Q06348 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Prrx2Q06348 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Prrx2Q06348 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Prrx2Q06348 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Prrx2Q06348 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Prrx2Q06348 Fam110a-202ENSMUST00000109863 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Prrx2Q06348 Zfp629-204ENSMUST00000128731 823 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Prrx2Q06348 Gm15738-202ENSMUST00000140892 427 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Prrx2Q06348 2310057J18Rik-201ENSMUST00000015663 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Prrx2Q06348 Gm29396-201ENSMUST00000185659 716 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Prrx2Q06348 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Prrx2Q06348 Gm37312-201ENSMUST00000195753 685 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Prrx2Q06348 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Prrx2Q06348 Tsc22d4-201ENSMUST00000031738 1043 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Prrx2Q06348 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Prrx2Q06348 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Prrx2Q06348 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Prrx2Q06348 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Prrx2Q06348 Gm6169-201ENSMUST00000071118 1030 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Prrx2Q06348 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Prrx2Q06348 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Prrx2Q06348 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Prrx2Q06348 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Prrx2Q06348 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Prrx2Q06348 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Prrx2Q06348 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Prrx2Q06348 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Prrx2Q06348 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Prrx2Q06348 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Prrx2Q06348 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Prrx2Q06348 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Prrx2Q06348 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Prrx2Q06348 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Prrx2Q06348 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Prrx2Q06348 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Prrx2Q06348 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Prrx2Q06348 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Prrx2Q06348 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Prrx2Q06348 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Prrx2Q06348 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Prrx2Q06348 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Prrx2Q06348 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Prrx2Q06348 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Prrx2Q06348 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Prrx2Q06348 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Prrx2Q06348 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Prrx2Q06348 Sectm1a-204ENSMUST00000106120 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Prrx2Q06348 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Prrx2Q06348 Gm12749-201ENSMUST00000122138 1159 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Prrx2Q06348 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Prrx2Q06348 Gm12315-201ENSMUST00000151599 911 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Prrx2Q06348 Egfl7-211ENSMUST00000152988 723 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Prrx2Q06348 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Prrx2Q06348 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Prrx2Q06348 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Prrx2Q06348 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Prrx2Q06348 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Prrx2Q06348 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Prrx2Q06348 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Prrx2Q06348 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Prrx2Q06348 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Prrx2Q06348 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Prrx2Q06348 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Prrx2Q06348 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Prrx2Q06348 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Prrx2Q06348 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms