Protein–RNA interactions for Protein: Q05895

Thbs3, Thrombospondin-3, mousemouse

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Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thbs3Q05895 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Thbs3Q05895 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Thbs3Q05895 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Thbs3Q05895 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Thbs3Q05895 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Thbs3Q05895 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Thbs3Q05895 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Thbs3Q05895 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Thbs3Q05895 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Thbs3Q05895 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Thbs3Q05895 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Thbs3Q05895 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Thbs3Q05895 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Thbs3Q05895 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Thbs3Q05895 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Thbs3Q05895 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Thbs3Q05895 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Thbs3Q05895 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Thbs3Q05895 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Thbs3Q05895 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Thbs3Q05895 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Thbs3Q05895 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Thbs3Q05895 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Thbs3Q05895 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Thbs3Q05895 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Thbs3Q05895 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Thbs3Q05895 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Thbs3Q05895 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Thbs3Q05895 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Thbs3Q05895 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Thbs3Q05895 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Thbs3Q05895 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Thbs3Q05895 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Thbs3Q05895 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Thbs3Q05895 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Thbs3Q05895 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Thbs3Q05895 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Thbs3Q05895 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Thbs3Q05895 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Thbs3Q05895 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Thbs3Q05895 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Thbs3Q05895 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Thbs3Q05895 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Thbs3Q05895 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Thbs3Q05895 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Thbs3Q05895 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Thbs3Q05895 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Thbs3Q05895 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Thbs3Q05895 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Thbs3Q05895 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Thbs3Q05895 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Thbs3Q05895 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Thbs3Q05895 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Thbs3Q05895 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Thbs3Q05895 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Thbs3Q05895 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Thbs3Q05895 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Thbs3Q05895 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Thbs3Q05895 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Thbs3Q05895 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Thbs3Q05895 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Thbs3Q05895 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Thbs3Q05895 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Thbs3Q05895 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Thbs3Q05895 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Thbs3Q05895 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Thbs3Q05895 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Thbs3Q05895 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Thbs3Q05895 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Thbs3Q05895 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Thbs3Q05895 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Thbs3Q05895 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Thbs3Q05895 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Thbs3Q05895 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Thbs3Q05895 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Thbs3Q05895 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Thbs3Q05895 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Thbs3Q05895 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Thbs3Q05895 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Thbs3Q05895 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Thbs3Q05895 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Thbs3Q05895 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Thbs3Q05895 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Thbs3Q05895 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Thbs3Q05895 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Thbs3Q05895 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Thbs3Q05895 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Thbs3Q05895 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Thbs3Q05895 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Thbs3Q05895 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Thbs3Q05895 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Thbs3Q05895 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Thbs3Q05895 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Thbs3Q05895 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Thbs3Q05895 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Thbs3Q05895 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Thbs3Q05895 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Thbs3Q05895 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Thbs3Q05895 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Thbs3Q05895 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.9 ms