Protein–RNA interactions for Protein: Q04890

Sox12, Transcription factor SOX-12, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox12Q04890 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Sox12Q04890 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Sox12Q04890 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Sox12Q04890 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Sox12Q04890 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Sox12Q04890 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Sox12Q04890 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Sox12Q04890 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Sox12Q04890 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Sox12Q04890 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Sox12Q04890 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Sox12Q04890 Gm15968-201ENSMUST00000119342 1168 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Sox12Q04890 Gm15351-201ENSMUST00000123920 419 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Sox12Q04890 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Sox12Q04890 Samd13-204ENSMUST00000147113 729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Sox12Q04890 Gm27516-201ENSMUST00000184237 98 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Sox12Q04890 Gm19572-201ENSMUST00000214326 338 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Sox12Q04890 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Sox12Q04890 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Sox12Q04890 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Sox12Q04890 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Sox12Q04890 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Sox12Q04890 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Sox12Q04890 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Sox12Q04890 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Sox12Q04890 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Sox12Q04890 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Sox12Q04890 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Sox12Q04890 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Sox12Q04890 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Sox12Q04890 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Sox12Q04890 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Sox12Q04890 Vmn1r24-201ENSMUST00000228097 1901 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Sox12Q04890 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Sox12Q04890 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Sox12Q04890 Prr27-202ENSMUST00000101056 1337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Sox12Q04890 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Sox12Q04890 Gm16440-201ENSMUST00000100900 1089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Sox12Q04890 Gm5795-201ENSMUST00000100920 984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Sox12Q04890 Gm21103-201ENSMUST00000112737 984 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Sox12Q04890 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Sox12Q04890 Gm3047-201ENSMUST00000164069 822 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Sox12Q04890 Vmn1r18-201ENSMUST00000164732 1087 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Sox12Q04890 Gm3029-201ENSMUST00000168306 984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Sox12Q04890 Gm3685-201ENSMUST00000169215 984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Sox12Q04890 Gm7876-201ENSMUST00000169465 984 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Sox12Q04890 Gm3043-201ENSMUST00000170639 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Sox12Q04890 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Sox12Q04890 Gm26671-201ENSMUST00000180423 1157 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Sox12Q04890 Gm9499-201ENSMUST00000180888 964 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Sox12Q04890 Gm18827-201ENSMUST00000188341 790 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Sox12Q04890 Gm38241-201ENSMUST00000192641 898 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Sox12Q04890 Gm37768-201ENSMUST00000192748 887 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Sox12Q04890 Gm43569-201ENSMUST00000196200 559 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Sox12Q04890 Olfr1449-202ENSMUST00000208624 1296 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Sox12Q04890 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Sox12Q04890 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Sox12Q04890 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Sox12Q04890 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Sox12Q04890 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Sox12Q04890 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Sox12Q04890 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Sox12Q04890 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Sox12Q04890 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Sox12Q04890 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Sox12Q04890 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Sox12Q04890 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Sox12Q04890 Clec12b-202ENSMUST00000112082 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Sox12Q04890 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Sox12Q04890 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Sox12Q04890 Tmem219-203ENSMUST00000120007 1087 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Sox12Q04890 Gm22985-201ENSMUST00000122754 116 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Sox12Q04890 4930502E09Rik-201ENSMUST00000126016 755 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Sox12Q04890 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Sox12Q04890 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Sox12Q04890 1600014C10Rik-203ENSMUST00000177983 403 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Sox12Q04890 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Sox12Q04890 Rpf2-206ENSMUST00000183309 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Sox12Q04890 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Sox12Q04890 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Sox12Q04890 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Sox12Q04890 Gm38247-201ENSMUST00000194675 433 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Sox12Q04890 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Sox12Q04890 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Sox12Q04890 AC132918.1-201ENSMUST00000227877 925 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Sox12Q04890 Olfr854-201ENSMUST00000072419 948 ntAPPRIS P2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Sox12Q04890 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Sox12Q04890 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Sox12Q04890 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Sox12Q04890 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Sox12Q04890 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Sox12Q04890 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Sox12Q04890 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Sox12Q04890 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Sox12Q04890 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Sox12Q04890 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Sox12Q04890 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Sox12Q04890 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Sox12Q04890 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Sox12Q04890 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.2 ms