Protein–RNA interactions for Protein: Q03402

Crisp3, Cysteine-rich secretory protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 241 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crisp3Q03402 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Crisp3Q03402 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Crisp3Q03402 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Crisp3Q03402 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Crisp3Q03402 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Crisp3Q03402 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Crisp3Q03402 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Crisp3Q03402 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Crisp3Q03402 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Crisp3Q03402 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Crisp3Q03402 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Crisp3Q03402 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Crisp3Q03402 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Crisp3Q03402 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Crisp3Q03402 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Crisp3Q03402 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Crisp3Q03402 Stk32b-201ENSMUST00000094836 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Crisp3Q03402 Mettl13-201ENSMUST00000028017 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Crisp3Q03402 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Crisp3Q03402 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Crisp3Q03402 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Crisp3Q03402 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Crisp3Q03402 CT025678.1-201ENSMUST00000214795 2972 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Crisp3Q03402 Myo10-201ENSMUST00000022882 5880 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Crisp3Q03402 Lpar1-205ENSMUST00000107575 3421 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Crisp3Q03402 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Crisp3Q03402 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Crisp3Q03402 Sh3kbp1-206ENSMUST00000112456 7317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Crisp3Q03402 Hars2-201ENSMUST00000019287 2002 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Crisp3Q03402 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Crisp3Q03402 Ylpm1-202ENSMUST00000101202 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Crisp3Q03402 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Crisp3Q03402 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Crisp3Q03402 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Crisp3Q03402 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Crisp3Q03402 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Crisp3Q03402 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Crisp3Q03402 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC11.02□□□□□ -0.64
Crisp3Q03402 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Crisp3Q03402 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Crisp3Q03402 Pcnx2-201ENSMUST00000047239 7236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Crisp3Q03402 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Crisp3Q03402 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Crisp3Q03402 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Crisp3Q03402 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Crisp3Q03402 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Crisp3Q03402 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Crisp3Q03402 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Crisp3Q03402 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Crisp3Q03402 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Crisp3Q03402 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Crisp3Q03402 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Crisp3Q03402 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Crisp3Q03402 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Crisp3Q03402 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Crisp3Q03402 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Crisp3Q03402 Atp2b2-203ENSMUST00000101045 8877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Crisp3Q03402 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Crisp3Q03402 Bmp7-201ENSMUST00000009143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Crisp3Q03402 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Crisp3Q03402 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Crisp3Q03402 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Crisp3Q03402 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Crisp3Q03402 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Crisp3Q03402 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Crisp3Q03402 Chd7-201ENSMUST00000039267 9444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Crisp3Q03402 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Crisp3Q03402 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Crisp3Q03402 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Crisp3Q03402 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Crisp3Q03402 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Crisp3Q03402 P4ha1-203ENSMUST00000105466 2918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Crisp3Q03402 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Crisp3Q03402 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Crisp3Q03402 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Crisp3Q03402 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Crisp3Q03402 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Crisp3Q03402 Amer2-201ENSMUST00000022561 10506 ntAPPRIS P1 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Crisp3Q03402 Arntl-206ENSMUST00000211770 2464 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Crisp3Q03402 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Crisp3Q03402 Sox7-201ENSMUST00000079652 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Crisp3Q03402 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Crisp3Q03402 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Crisp3Q03402 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Crisp3Q03402 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Crisp3Q03402 Pappa-201ENSMUST00000084501 11027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Crisp3Q03402 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Crisp3Q03402 Tcf12-218ENSMUST00000184783 3489 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Crisp3Q03402 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Crisp3Q03402 Wfs1-201ENSMUST00000043964 3787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Crisp3Q03402 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Crisp3Q03402 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Crisp3Q03402 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Crisp3Q03402 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Crisp3Q03402 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Crisp3Q03402 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Crisp3Q03402 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Crisp3Q03402 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Crisp3Q03402 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Crisp3Q03402 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms